40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0816 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0816  lipase, class 3  100 
 
 		 726 aa  1504    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0149  lipase, class 3  40.11 
 
 		 727 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3485  lipase family protein  41.81 
 
 		 758 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0992541  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3943  lipase family protein  37.38 
 
 		 539 aa  327  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1028  hypothetical protein  27.09 
 
 		 641 aa  126  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1892  lipase, class 3  32 
 
 		 378 aa  73.6  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.184018  hitchhiker  0.008794 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4993  lipase family protein  30.63 
 
 		 240 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5022  lipase family protein  28.34 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5004  lipase family protein  28.34 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2407  lipase family protein  24.52 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0583209  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0244  lipase family protein  30 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00506661  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4616  lipase  28.9 
 
 		 240 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5117  lipase family protein  28.32 
 
 		 240 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.611246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4974  lipase family protein  28.32 
 
 		 240 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4594  lipase  28.32 
 
 		 240 aa  63.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0532925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4756  lipase family protein  28.32 
 
 		 240 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4704  lipase class 3  30.28 
 
 		 240 aa  62.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3499  lipase class 3  29.79 
 
 		 240 aa  62  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.304459  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1781  lipase family protein  28.28 
 
 		 277 aa  59.7  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1685  lipase, class 3  28.64 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0870  lipase, class 3  32.35 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2065  lipase class 3  30.94 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3132  lipase, class 3  34.53 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.95393  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08046  extracellular lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02040)  30.07 
 
 		 294 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2380  lipase class 3  28.57 
 
 		 387 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2431  lipase class 3  28.57 
 
 		 387 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004314  predicted lipase  31.03 
 
 		 379 aa  54.7  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10605  conserved hypothetical protein  32.89 
 
 		 308 aa  54.3  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05777  extracellular triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06510)  28.92 
 
 		 404 aa  54.3  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  24.85 
 
 		 258 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3843  hypothetical protein  31.25 
 
 		 381 aa  53.9  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.366486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24393  predicted protein  28.66 
 
 		 694 aa  53.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0272  lipase, class 3  28.89 
 
 		 266 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1065  galactose-1-phosphate uridyl transferase, class I  29.45 
 
 		 299 aa  48.5  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10321  predicted protein  28.17 
 
 		 234 aa  48.1  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000376906  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28505  triacylglycerol lipase precursor  23.84 
 
 		 350 aa  47.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0075  lipase family protein  27.75 
 
 		 336 aa  46.6  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43593  predicted protein  40.24 
 
 		 448 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.131498  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60390  triacylglycerol lipase  26.14 
 
 		 313 aa  45.8  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1267  lipase, class 3  24.63 
 
 		 261 aa  45.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>