More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0806 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  49.33 
 
 
702 aa  694  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  48.93 
 
 
698 aa  688  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  100 
 
 
743 aa  1527  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  49.8 
 
 
726 aa  694  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  48.93 
 
 
698 aa  688  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  48.93 
 
 
698 aa  688  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  47.53 
 
 
714 aa  630  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  45.78 
 
 
696 aa  591  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  45.78 
 
 
696 aa  591  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  43.95 
 
 
695 aa  581  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  41.15 
 
 
806 aa  533  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  37.45 
 
 
804 aa  480  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.34979e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  38.94 
 
 
696 aa  465  1e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  38.79 
 
 
702 aa  460  1e-128  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  38 
 
 
698 aa  449  1e-124  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  37.21 
 
 
696 aa  447  1e-124  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  39.36 
 
 
656 aa  441  1e-122  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  35.51 
 
 
653 aa  423  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  36.2 
 
 
666 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  36.51 
 
 
666 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  36.51 
 
 
666 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  35.83 
 
 
666 aa  416  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  36.65 
 
 
666 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  8.97059e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  38.06 
 
 
665 aa  411  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  35.19 
 
 
663 aa  407  1e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  34.49 
 
 
663 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  36.92 
 
 
740 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  34.87 
 
 
665 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  34.87 
 
 
665 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  34.87 
 
 
665 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  35.59 
 
 
700 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  34.58 
 
 
713 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  34.69 
 
 
655 aa  372  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  36.39 
 
 
698 aa  369  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  34.51 
 
 
676 aa  360  5e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  34.68 
 
 
656 aa  353  7e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 
658 aa  352  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  34.3 
 
 
659 aa  347  6e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  34.35 
 
 
652 aa  345  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  5.07235e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  34.75 
 
 
650 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  34.75 
 
 
650 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  34.75 
 
 
650 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  33.91 
 
 
663 aa  345  3e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  33.91 
 
 
663 aa  345  3e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 
663 aa  343  5e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  33.77 
 
 
663 aa  343  5e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  33.77 
 
 
663 aa  343  5e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  34.52 
 
 
650 aa  343  6e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  33.77 
 
 
663 aa  343  6e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  34.47 
 
 
650 aa  343  6e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  33.77 
 
 
641 aa  343  8e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 
652 aa  337  6e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 
715 aa  326  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  34.77 
 
 
680 aa  322  1e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 
799 aa  322  2e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  33.39 
 
 
572 aa  322  2e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 
799 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 
664 aa  316  8e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 
799 aa  315  1e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  31.42 
 
 
732 aa  315  2e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  30.82 
 
 
704 aa  309  1e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  30.28 
 
 
697 aa  298  3e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  32.61 
 
 
653 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  30.69 
 
 
656 aa  294  3e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  32.53 
 
 
635 aa  287  6e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 
681 aa  276  7e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 
665 aa  270  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  29.84 
 
 
739 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 
649 aa  231  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  3.09269e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 
649 aa  230  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 
649 aa  230  9e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 
653 aa  227  7e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 
661 aa  222  2e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 
680 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  29.05 
 
 
640 aa  219  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 
662 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 
662 aa  217  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 
662 aa  216  1e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 
657 aa  209  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 
648 aa  208  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  28.23 
 
 
746 aa  204  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  27.54 
 
 
744 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  28.17 
 
 
744 aa  193  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  27.31 
 
 
744 aa  188  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 
650 aa  187  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  27.13 
 
 
742 aa  184  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  26.78 
 
 
742 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  27.54 
 
 
746 aa  181  6e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  27.64 
 
 
746 aa  178  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1811  diaminopimelate epimerase (DAP epimerase)  34.26 
 
 
330 aa  177  7e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  27.03 
 
 
740 aa  177  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  26.78 
 
 
703 aa  175  3e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  27.45 
 
 
633 aa  172  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.58389e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  26.6 
 
 
757 aa  170  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  25.6 
 
 
749 aa  166  2e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  26.47 
 
 
746 aa  160  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  27 
 
 
759 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1977  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA 2 (Sulfate-transporting ATPase 2)  38.26 
 
 
326 aa  157  5e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  25.54 
 
 
746 aa  156  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  1.36629e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  25.54 
 
 
746 aa  156  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.04738e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>