73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0767 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  100 
 
 
182 aa  361  3e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  75.29 
 
 
177 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  74.25 
 
 
174 aa  251  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  72.56 
 
 
175 aa  249  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  59.86 
 
 
149 aa  165  3e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  59.18 
 
 
146 aa  164  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  52.69 
 
 
181 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  54.97 
 
 
151 aa  159  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  57.45 
 
 
144 aa  155  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  53.66 
 
 
167 aa  155  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  49.68 
 
 
165 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  49.38 
 
 
167 aa  148  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  46.5 
 
 
184 aa  145  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  43.58 
 
 
206 aa  137  9e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  47.8 
 
 
155 aa  130  1e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  49.04 
 
 
165 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  46.01 
 
 
178 aa  119  2e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2198  hypothetical protein  43.21 
 
 
159 aa  115  4e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  37.42 
 
 
174 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  42.4 
 
 
151 aa  74.3  9e-13  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  35.48 
 
 
162 aa  73.2  2e-12  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  35.76 
 
 
200 aa  70.5  1e-11  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  34 
 
 
153 aa  70.9  1e-11  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  41.35 
 
 
181 aa  65.9  3e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  34.78 
 
 
189 aa  63.9  1e-09  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  30.82 
 
 
163 aa  64.3  1e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0106  hypothetical protein  41.23 
 
 
190 aa  63.9  1e-09  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  36.42 
 
 
190 aa  63.5  2e-09  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  35.2 
 
 
189 aa  62  5e-09  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  8.5919e-08  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  33.08 
 
 
143 aa  61.6  6e-09  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2298  MOSC domain containing protein  36.43 
 
 
142 aa  61.2  7e-09  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  33.08 
 
 
160 aa  60.1  2e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1811  MOSC  32.21 
 
 
158 aa  59.3  3e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  39.02 
 
 
178 aa  57.8  8e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  31.25 
 
 
145 aa  56.6  2e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0082  MOSC domain-containing protein  29.68 
 
 
164 aa  54.7  8e-07  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  29.86 
 
 
145 aa  52.4  3e-06  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.03173e-05 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2483  hypothetical protein  30 
 
 
179 aa  52.8  3e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0431097  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  31.47 
 
 
146 aa  52.8  3e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  37.06 
 
 
156 aa  52.4  3e-06  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  30.5 
 
 
145 aa  52.4  4e-06  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5597  hypothetical protein  34.76 
 
 
179 aa  52.4  4e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1442  MOSC domain-containing protein  28.91 
 
 
158 aa  51.2  7e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  29.86 
 
 
145 aa  50.4  1e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  1.72861e-08 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0061  MOSC domain-containing protein  33.08 
 
 
201 aa  50.1  2e-05  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.489415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1741  MOSC domain-containing protein  32.79 
 
 
153 aa  48.9  4e-05  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  33.09 
 
 
146 aa  48.5  6e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4234  MOSC domain-containing protein  28.92 
 
 
180 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37433  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0055  hypothetical protein  25 
 
 
240 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0017  hypothetical protein  28.67 
 
 
148 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1294  hypothetical protein  36.84 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0018  hypothetical protein  31.06 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0016  hypothetical protein  28.47 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0010  hypothetical protein  29.37 
 
 
150 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.276585  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2674  MOSC domain-containing protein  34.88 
 
 
148 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2719  MOSC domain-containing protein  34.88 
 
 
148 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.005456  normal  0.132425 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0016  hypothetical protein  27.97 
 
 
148 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2705  MOSC domain-containing protein  34.88 
 
 
148 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705945  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0012  hypothetical protein  27.27 
 
 
148 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2235  MOSC domain-containing protein  30 
 
 
144 aa  44.3  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2403  MOSC domain-containing protein  29.81 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524087  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2836  MOSC domain-containing protein  32.68 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.654473  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0016  hypothetical protein  27.27 
 
 
148 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49396e-06 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  32.23 
 
 
262 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1952  MOSC domain containing protein  30.61 
 
 
143 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1617  MOSC domain containing protein  36.56 
 
 
218 aa  42  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1138  MOSC domain-containing protein  31.33 
 
 
234 aa  42  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2930  MOSC domain containing protein  26.53 
 
 
143 aa  41.6  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1774  MOSC domain-containing protein  39.73 
 
 
209 aa  41.6  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000110547  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  32.69 
 
 
147 aa  41.6  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64470  hypothetical protein  34.83 
 
 
98 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2271  MOSC domain containing protein  29.93 
 
 
143 aa  41.6  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0010  hypothetical protein  28.08 
 
 
147 aa  40.8  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>