57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0741 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_0741  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  206  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5511  hypothetical protein  74 
 
 
101 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63300  hypothetical protein  74 
 
 
101 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0819333  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0632  hypothetical protein  74.75 
 
 
100 aa  133  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0624  hypothetical protein  76.77 
 
 
101 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0618  hypothetical protein  74.26 
 
 
101 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121105  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4585  hypothetical protein  74.26 
 
 
101 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.744837  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0579  hypothetical protein  74.26 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0642  hypothetical protein  72.28 
 
 
101 aa  127  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0741  hypothetical protein  71.29 
 
 
101 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.194088  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07270  hypothetical protein  68.32 
 
 
101 aa  122  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713838  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0013  hypothetical protein  48 
 
 
118 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.995444  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4851  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  45.54 
 
 
117 aa  93.6  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.563845  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0582  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  51.55 
 
 
104 aa  92.8  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0603  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  51.55 
 
 
104 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.963976 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2084  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  48.94 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.311505  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0014  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  45.54 
 
 
126 aa  91.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00301608 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0280  hypothetical protein  47.96 
 
 
131 aa  90.9  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1125  hypothetical protein  42.86 
 
 
123 aa  90.5  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.874938 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0029  hypothetical protein  52.44 
 
 
110 aa  90.5  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4014  hypothetical protein  54.88 
 
 
109 aa  90.1  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0591  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  45.74 
 
 
116 aa  87.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1858  mannonate dehydratase  44.55 
 
 
102 aa  87.4  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.401436  normal  0.311275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1343  hypothetical protein  45.54 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0679  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  41.58 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.511442  hitchhiker  0.0000132281 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1078  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  82.8  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1735  hypothetical protein  42.86 
 
 
116 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.303631 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18560  predicted pyrophosphatase  42.57 
 
 
120 aa  82  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254127  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1298  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  45.05 
 
 
120 aa  81.3  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2074  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  41.11 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266897  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1293  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  38.3 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131741  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3445  hypothetical protein  43.3 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0200  hypothetical protein  41.58 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.190025  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4182  hypothetical protein  45.12 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1530  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  44.09 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4465  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  39.8 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7171  hypothetical protein  41.46 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1669  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  43.21 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1237  hypothetical protein  38.3 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3228  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  36 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.491716  normal  0.0212378 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2453  hypothetical protein  43.18 
 
 
118 aa  67  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3441  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  35.63 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000605354  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2737  hypothetical protein  35 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411617  normal  0.738085 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0553  putative pyrophosphatase  32.63 
 
 
126 aa  62.8  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1513  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  34.52 
 
 
99 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3800  hypothetical protein  32.18 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000403313  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3518  hypothetical protein  32.18 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000729179  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0928  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  33.67 
 
 
110 aa  61.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000193078  unclonable  0.00000000000231926 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1357  hypothetical protein  31 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2385  hypothetical protein  34.65 
 
 
121 aa  57.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0167763  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0041  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  38.83 
 
 
102 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
265 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2244  hypothetical protein  34.34 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000059482  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0253  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  34 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19640  predicted pyrophosphatase  33.33 
 
 
106 aa  50.8  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2161  putative cytoplasmic protein  35.71 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0722  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  41.86 
 
 
118 aa  40  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000451549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>