150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0736 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  279  8.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  72.03 
 
 
149 aa  173  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  72.73 
 
 
149 aa  173  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  45.89 
 
 
147 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  47.92 
 
 
146 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  36.99 
 
 
147 aa  98.6  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  45.45 
 
 
144 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  45.77 
 
 
144 aa  99  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  40.43 
 
 
178 aa  98.2  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  36.36 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  36.67 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  37.09 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  39.01 
 
 
172 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  38.57 
 
 
174 aa  87.8  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  36.3 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  36.43 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  39.29 
 
 
184 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  35 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  37.09 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  40.74 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  37.93 
 
 
297 aa  84  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  35.95 
 
 
151 aa  83.6  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  42.11 
 
 
132 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  34.44 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  36.03 
 
 
151 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  40.16 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  41.38 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  42.07 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  37.98 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  38.35 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  42.73 
 
 
170 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  42.73 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  35.25 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  34.75 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  35.46 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  36.72 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  34.75 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  38.24 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  38.57 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  34.62 
 
 
317 aa  75.5  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  37.14 
 
 
318 aa  75.5  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  35.82 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  35.42 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  37.88 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  37.5 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  35.71 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  32 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  41.38 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  36.24 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  36.24 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  41.38 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  42.96 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  34.11 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  34.51 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  32.59 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  35.56 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  37.59 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  35.56 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  31.65 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3996  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.33 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.318499  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  34.04 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  32.85 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  35.29 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  34.04 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  33.1 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  32.64 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4288  protein of unknown function DUF606  33.08 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251888  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  30.07 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  32.58 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  30.28 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  30.28 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  29.5 
 
 
183 aa  63.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  33.1 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  29.93 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  30.28 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3765  hypothetical protein  38.32 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  31.62 
 
 
153 aa  60.5  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1329  hypothetical protein  29.79 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.886868 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  38.96 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  38.96 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  29.86 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  38.96 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  29.5 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  28.12 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  27.34 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  32.09 
 
 
147 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1296  hypothetical protein  34.56 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443184  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  27.34 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  32.86 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  31.29 
 
 
177 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  33.59 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04990  hypothetical protein  40.44 
 
 
318 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3766  hypothetical protein  34.94 
 
 
162 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1082  hypothetical protein  27.03 
 
 
321 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0823  hypothetical protein  34.19 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3861  hypothetical protein  27.92 
 
 
322 aa  53.9  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3751  putative inner membrane protein  27.92 
 
 
323 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3920  putative inner membrane protein  27.92 
 
 
323 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.324261  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3740  hypothetical protein  27.92 
 
 
323 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3818  hypothetical protein  27.92 
 
 
323 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>