More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0734 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.34 
 
 		 645 aa  770    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  66.46 
 
 		 645 aa  828    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.34 
 
 		 645 aa  771    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 643 aa  1271    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.72 
 
 		 645 aa  764    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.81 
 
 		 645 aa  785    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.74 
 
 		 640 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  36.58 
 
 		 641 aa  396  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0596  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.99 
 
 		 640 aa  385  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.270432 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.73 
 
 		 638 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.43 
 
 		 636 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.72 
 
 		 638 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  38.37 
 
 		 639 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.24 
 
 		 638 aa  355  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0275  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.94 
 
 		 638 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0282  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.94 
 
 		 641 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149105  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.94 
 
 		 638 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.411591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0279  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.94 
 
 		 638 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.983838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 		 638 aa  352  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.408395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4454  methyl-accepting chemotaxis protein  36.34 
 
 		 642 aa  347  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.86 
 
 		 638 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.758035  hitchhiker  0.0000678809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.86 
 
 		 638 aa  340  7e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.666265  normal  0.186245 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0272  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.01 
 
 		 638 aa  340  7e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00090491  hitchhiker  0.000000349734 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1102  methyl-accepting chemotaxis protein  35.19 
 
 		 638 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3522  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.11 
 
 		 636 aa  331  3e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.76 
 
 		 650 aa  319  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2239  chemotaxis sensory transducer  31.68 
 
 		 648 aa  312  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001273  methyl-accepting chemotaxis protein  34.15 
 
 		 638 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0552  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.86 
 
 		 648 aa  311  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283806  decreased coverage  0.00439756 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00464  methyl-accepting chemotaxis protein  32.55 
 
 		 636 aa  302  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  43.11 
 
 		 712 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  42.61 
 
 		 712 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.1 
 
 		 627 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1067  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.71 
 
 		 634 aa  272  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.19 
 
 		 630 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  32.4 
 
 		 629 aa  271  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  32.25 
 
 		 629 aa  270  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  38.4 
 
 		 688 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.17 
 
 		 555 aa  266  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0604  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.21 
 
 		 641 aa  265  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.471742  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.85 
 
 		 637 aa  265  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  32.15 
 
 		 632 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.07 
 
 		 541 aa  265  3e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.5 
 
 		 554 aa  264  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.45 
 
 		 688 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.124474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  32.72 
 
 		 632 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.14 
 
 		 688 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.21 
 
 		 716 aa  260  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  35.02 
 
 		 623 aa  259  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.84 
 
 		 548 aa  258  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4190  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.02 
 
 		 688 aa  259  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.71 
 
 		 554 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.89 
 
 		 647 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.494937  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0584  methyl-accepting chemotaxis transducer  36.46 
 
 		 647 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77697  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  40.38 
 
 		 545 aa  257  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.13 
 
 		 674 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  41.47 
 
 		 545 aa  254  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  35.33 
 
 		 646 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.74 
 
 		 671 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0657  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  32.97 
 
 		 648 aa  252  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  40.31 
 
 		 713 aa  253  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.96 
 
 		 630 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.69 
 
 		 636 aa  252  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.19 
 
 		 554 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.96 
 
 		 630 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.19 
 
 		 554 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.16 
 
 		 637 aa  251  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2448  methyl-accepting chemotaxis protein  34.9 
 
 		 646 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.718596  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.96 
 
 		 630 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.96 
 
 		 630 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.19 
 
 		 554 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.19 
 
 		 554 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  44.08 
 
 		 559 aa  251  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.55 
 
 		 558 aa  251  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  34.94 
 
 		 630 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.03 
 
 		 648 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.4 
 
 		 626 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  35.27 
 
 		 554 aa  248  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.29 
 
 		 634 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.52 
 
 		 620 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3736  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.52 
 
 		 620 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.0212994 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.03 
 
 		 630 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.64 
 
 		 554 aa  248  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  33.73 
 
 		 623 aa  248  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.12 
 
 		 554 aa  248  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.7 
 
 		 568 aa  248  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.19 
 
 		 554 aa  248  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.03 
 
 		 638 aa  248  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.89 
 
 		 647 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624074  hitchhiker  0.000681907 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3785  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.52 
 
 		 620 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0060774  normal  0.0147123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.82 
 
 		 544 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  33.08 
 
 		 630 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  33.55 
 
 		 626 aa  247  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.11 
 
 		 630 aa  247  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.19 
 
 		 554 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  32.02 
 
 		 629 aa  246  8e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.42 
 
 		 631 aa  246  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.87 
 
 		 634 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  34.66 
 
 		 626 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  36.84 
 
 		 714 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>