More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0622 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
271 aa  548  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  72.59 
 
 
613 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5685  thiosulfate sulfurtransferase  72.96 
 
 
271 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  71.48 
 
 
610 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0510  rhodanese-like protein  72.22 
 
 
271 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.628271  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65480  thiosulfate sulfurtransferase  73.06 
 
 
271 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07450  Rhodanese  71.85 
 
 
271 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4907  rhodanese domain protein  70 
 
 
269 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4960  rhodanese domain-containing protein  70.74 
 
 
269 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4783  rhodanese domain-containing protein  70 
 
 
269 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4699  rhodanese domain-containing protein  70 
 
 
269 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  50.9 
 
 
276 aa  263  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2678  fused rhodanese domain-containing protein/phosphatidylserine decarboxylase  44.69 
 
 
276 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  42.8 
 
 
270 aa  221  7e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  44.12 
 
 
273 aa  209  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  38.72 
 
 
272 aa  183  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  36.4 
 
 
288 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  35.74 
 
 
286 aa  143  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  33.1 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  29.43 
 
 
258 aa  138  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  32.75 
 
 
281 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  30.66 
 
 
286 aa  135  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  33.09 
 
 
285 aa  133  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  32.41 
 
 
289 aa  132  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  32.82 
 
 
281 aa  130  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  32.49 
 
 
366 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  30.64 
 
 
296 aa  128  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  31.45 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  32.58 
 
 
282 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0501  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 
285 aa  126  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  34.57 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1565  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 
275 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  32.4 
 
 
291 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  32.08 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  32.08 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  32.08 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  30.96 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  31.78 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  31.78 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  31.82 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  32.45 
 
 
277 aa  119  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  30.1 
 
 
301 aa  119  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  33.6 
 
 
297 aa  119  7e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  33.45 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  33.45 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.45 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.45 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  31.62 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  33.45 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  33.45 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  33.45 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  33.57 
 
 
305 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  32.2 
 
 
281 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  32 
 
 
304 aa  115  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0253  Rhodanese domain protein  32.57 
 
 
265 aa  115  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  32.36 
 
 
277 aa  116  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1171  Rhodanese domain protein  33.59 
 
 
305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963951  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  29.89 
 
 
293 aa  115  7.999999999999999e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  30.65 
 
 
291 aa  115  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2047  rhodanese-like protein  28.46 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000810205  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  32.5 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  31.85 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  30.28 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  31.07 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  33.88 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  29.67 
 
 
277 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  29.67 
 
 
277 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  29.67 
 
 
277 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  29.67 
 
 
277 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  32.65 
 
 
298 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 
298 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 
298 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  30.51 
 
 
321 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  29.35 
 
 
300 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  29.67 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7584  rhodanese domain-containing protein  31.79 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  29.27 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2805  rhodanese domain-containing protein  30.31 
 
 
362 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  28.63 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  31.43 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  32.12 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  30.89 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  29.77 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  31.58 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  27.8 
 
 
279 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  31.09 
 
 
282 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  31.43 
 
 
312 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  31.16 
 
 
289 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.71 
 
 
299 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  30.04 
 
 
277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.43 
 
 
289 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  32.39 
 
 
275 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  29.67 
 
 
289 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  29.48 
 
 
281 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  31.84 
 
 
280 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  30.77 
 
 
277 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  30.77 
 
 
277 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6380  Rhodanese domain protein  31.46 
 
 
280 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>