135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0605 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_0605  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  417  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4792  hypothetical protein  75.62 
 
 
202 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.528676  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4969  hypothetical protein  75.12 
 
 
202 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4916  hypothetical protein  75.62 
 
 
247 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0498  hypothetical protein  73 
 
 
202 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4708  hypothetical protein  73.13 
 
 
202 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.731095 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4964  hypothetical protein  70.5 
 
 
205 aa  293  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65670  hypothetical protein  71.08 
 
 
206 aa  292  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0550  hypothetical protein  70.35 
 
 
205 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5697  hypothetical protein  70.59 
 
 
206 aa  289  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43490  hypothetical protein  72.59 
 
 
205 aa  287  8e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2574  esterase  50 
 
 
185 aa  169  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2615  protein of unknown function UPF0227  44.95 
 
 
207 aa  158  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3025  protein of unknown function UPF0227  43.94 
 
 
207 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2781  hypothetical protein  44.44 
 
 
210 aa  154  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.290631 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0729  hypothetical protein  45.16 
 
 
191 aa  152  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000799226 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3900  hypothetical protein  44.09 
 
 
191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3675  protein of unknown function UPF0227  43.75 
 
 
195 aa  151  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0757  hypothetical protein  44.09 
 
 
191 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.168222  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0817  hypothetical protein  45.16 
 
 
191 aa  147  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.45898  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3232  hypothetical protein  43.55 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243033 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0810  protein of unknown function UPF0227  45.16 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0617063  unclonable  0.00000000000196592 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3574  hypothetical protein  43.55 
 
 
191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.819327  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0548  hypothetical protein  42.47 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.728764 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0785  hypothetical protein  44.62 
 
 
191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.841402  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3559  hypothetical protein  44.44 
 
 
190 aa  145  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0871904  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0772  hypothetical protein  44.09 
 
 
191 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.40876  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0373  DNA repair protein RadA  43.09 
 
 
196 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3910  hypothetical protein  40.64 
 
 
189 aa  141  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0778  hypothetical protein  43.78 
 
 
192 aa  141  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0337067  hitchhiker  0.0000000017764 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2284  hydrolase, putative  42.93 
 
 
188 aa  141  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.560152  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2774  hypothetical protein  42.55 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3440  esterase YqiA  41.67 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3433  esterase YqiA  41.67 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3535  esterase YqiA  41.67 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3368  esterase YqiA  41.67 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.898538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3363  esterase YqiA  41.15 
 
 
193 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.321525  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4177  hypothetical protein  39.7 
 
 
205 aa  138  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3044  hypothetical protein  44.62 
 
 
191 aa  138  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.93923 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3615  esterase YqiA  42.02 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0434  hypothetical protein  41.18 
 
 
197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0244352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03686  predicted esterase  42.25 
 
 
193 aa  135  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.040582  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3693  hypothetical protein  42.08 
 
 
189 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.695003 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3773  esterase YqiA  41.05 
 
 
193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4264  esterase YqiA  37.11 
 
 
194 aa  132  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4191  hypothetical protein  39.78 
 
 
192 aa  132  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3221  hypothetical protein  40.84 
 
 
191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0512  hypothetical protein  40.98 
 
 
189 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0579  hypothetical protein  41.53 
 
 
189 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134337 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3444  esterase YqiA  38.22 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0536  hypothetical protein  40.44 
 
 
189 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.975326 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0128  hypothetical protein  40.98 
 
 
189 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0611  hypothetical protein  40.98 
 
 
189 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02903  predicted esterase  38.42 
 
 
193 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0669  protein of unknown function UPF0227  38.42 
 
 
193 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02853  hypothetical protein  38.42 
 
 
193 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4345  esterase YqiA  38.42 
 
 
193 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3209  esterase YqiA  38.42 
 
 
193 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.451681  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3495  esterase YqiA  38.42 
 
 
193 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0666  esterase YqiA  38.42 
 
 
193 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0149412 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3326  esterase YqiA  38.42 
 
 
193 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.901515  normal  0.753431 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0318  esterase YqiA  37.37 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2009  esterase YqiA  42.31 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001762  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3328  hypothetical protein  39.78 
 
 
190 aa  125  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.33198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0280  esterase YqiA  35.94 
 
 
193 aa  125  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0577  esterase YqiA  35.94 
 
 
193 aa  124  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0327  esterase YqiA  36.84 
 
 
193 aa  124  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.172049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0658  esterase YqiA  35.94 
 
 
193 aa  124  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3464  esterase YqiA  37.89 
 
 
193 aa  123  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0537  esterase  38.92 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.970145 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3059  hypothetical protein  37.04 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0763201  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1169  hypothetical protein  41.62 
 
 
189 aa  118  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2545  hypothetical protein  40.31 
 
 
225 aa  118  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2671  esterase YqiA  40 
 
 
194 aa  117  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2496  hypothetical protein  38.5 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0562074  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0416  hypothetical protein  38.5 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1276  hypothetical protein  38.5 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3460  hypothetical protein  38.5 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3498  hypothetical protein  38.5 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374032  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3289  hypothetical protein  38.5 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3495  esterase  38.5 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3375  hypothetical protein  38.1 
 
 
200 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2624  hypothetical protein  37.3 
 
 
200 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3357  hypothetical protein  35.64 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0517528 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004518  putative esterase  38.89 
 
 
194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3198  hypothetical protein  37.23 
 
 
198 aa  115  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0410762 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3421  protein of unknown function UPF0227  37.84 
 
 
200 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal  0.0514179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3401  hypothetical protein  36.76 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.435883  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0959  hypothetical protein  33.69 
 
 
196 aa  109  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3555  hypothetical protein  38.65 
 
 
165 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0761566  normal  0.0880721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1090  hypothetical protein  34.9 
 
 
199 aa  104  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2860  hypothetical protein  35.11 
 
 
202 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0037  protein of unknown function UPF0227  34.38 
 
 
190 aa  101  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0890  protein of unknown function UPF0227  34.36 
 
 
173 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.119021  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2415  hypothetical protein  32.5 
 
 
210 aa  99  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00873  esterase YqiA  44.07 
 
 
175 aa  97.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0584  protein of unknown function UPF0227  31.28 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3978  hypothetical protein  33.86 
 
 
207 aa  95.9  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00232425 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2959  protein of unknown function UPF0227  34.54 
 
 
195 aa  94.7  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0148582  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3649  hypothetical protein  34.02 
 
 
195 aa  94  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>