More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0561 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0517  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  78.2 
 
 		 600 aa  975    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0563795  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4948  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  77.7 
 
 		 600 aa  969    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.669366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66350  putative acyl-CoA dehydrogenase  83.03 
 
 		 600 aa  1046    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1762  acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  56.49 
 
 		 625 aa  668    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1485  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.66 
 
 		 622 aa  670    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275641  normal  0.0574258 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5032  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  62.21 
 
 		 601 aa  750    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.690717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5020  acyl-CoA dehydrogenase family protein  78.7 
 
 		 600 aa  994    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0505  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  78.87 
 
 		 600 aa  998    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1408  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  54.85 
 
 		 618 aa  653    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4675  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  56.67 
 
 		 597 aa  655    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0451  Acyl-CoA dehydrogenase-like  81.53 
 
 		 600 aa  1033    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.821544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5757  putative acyl-CoA dehydrogenase  82.36 
 
 		 600 aa  1039    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4821  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  77.87 
 
 		 600 aa  973    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4997  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  78.2 
 
 		 600 aa  975    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1227  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.08 
 
 		 599 aa  650    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.556988  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0119  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.66 
 
 		 588 aa  642    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0100  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.5 
 
 		 588 aa  639    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.119602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2868  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  57.5 
 
 		 602 aa  685    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0561  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 		 622 aa  1290    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000252916 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1444  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  56.14 
 
 		 622 aa  674    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0386828 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1852  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  55.65 
 
 		 619 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.232086 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2405  acyl-CoA dehydrogenase-like  54.77 
 
 		 598 aa  637    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0110  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  54.66 
 
 		 588 aa  642    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.242894  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2141  acyl-CoA dehydrogenase-like  53.73 
 
 		 616 aa  664    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2845  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.74 
 
 		 600 aa  694    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.26253  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2066  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.66 
 
 		 601 aa  637    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01005  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  52.33 
 
 		 611 aa  632  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2720  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53 
 
 		 592 aa  615  1e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1320  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.74 
 
 		 609 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.895638 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1258  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.32 
 
 		 609 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4473  Acyl-CoA dehydrogenase  51.69 
 
 		 609 aa  600  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.15 
 
 		 591 aa  599  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1004  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.33 
 
 		 601 aa  600  1e-170  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1233  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.67 
 
 		 609 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0860  acyl-CoA dehydrogenase-like  52.42 
 
 		 609 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1341  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.42 
 
 		 609 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0861  acyl-CoA dehydrogenase-like  49.83 
 
 		 601 aa  587  1e-166  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1582  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.99 
 
 		 598 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.900007  decreased coverage  0.00956274 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7558  Acyl-CoA dehydrogenase  50.73 
 
 		 607 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0382442  normal  0.166512 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0702  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.75 
 
 		 606 aa  565  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1777  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.57 
 
 		 617 aa  558  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130183  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2570  acyl-CoA dehydrogenase-like  49.76 
 
 		 627 aa  555  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215249  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1573  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.83 
 
 		 599 aa  548  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.77864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2922  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50 
 
 		 617 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3315  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.24 
 
 		 645 aa  546  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00913148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2017  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.13 
 
 		 619 aa  538  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.875107  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2877  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.58 
 
 		 652 aa  532  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2384  acyl-CoA dehydrogenase-like  49.35 
 
 		 618 aa  530  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225519  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1687  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.18 
 
 		 642 aa  530  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.291033 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1853  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.86 
 
 		 608 aa  498  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.771828  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1076  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.03 
 
 		 606 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.276449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1790  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.36 
 
 		 563 aa  473  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4640  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.19 
 
 		 599 aa  456  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2164  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.47 
 
 		 605 aa  415  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000583422  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2366  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.85 
 
 		 601 aa  415  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000727045  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1308  Acyl-CoA dehydrogenase  38.93 
 
 		 596 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135322  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1741  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.15 
 
 		 594 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6066  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  40.38 
 
 		 598 aa  395  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2140  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  37.98 
 
 		 600 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5166  Acyl-CoA dehydrogenase-like  41.39 
 
 		 592 aa  395  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09630  putative acyl-CoA dehydrogenase  40.13 
 
 		 593 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.806665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1305  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.76 
 
 		 604 aa  395  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000712718  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45920  acyl-CoA dehydrogenase  40.63 
 
 		 601 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1754  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.92 
 
 		 594 aa  395  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0420795 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0213  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.73 
 
 		 598 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3819  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.18 
 
 		 590 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0609  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.04 
 
 		 592 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.666513  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2211  Acyl-CoA dehydrogenase-like  36.07 
 
 		 615 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0172956  normal  0.0102784 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0578  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.03 
 
 		 595 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0661  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.76 
 
 		 595 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4832  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.9 
 
 		 592 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.93 
 
 		 595 aa  389  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.92 
 
 		 598 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.986474  normal  0.238183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0400  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.67 
 
 		 592 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672876 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0370  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.12 
 
 		 592 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2926  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.52 
 
 		 596 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2639  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.86 
 
 		 595 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0601004  normal  0.257028 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.52 
 
 		 596 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4476  acyl-CoA dehydrogenase family protein  38.91 
 
 		 602 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0363  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.42 
 
 		 595 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.84094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0899  putative acyl-CoA dehydrogenase  40.3 
 
 		 593 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183433  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6368  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  38.64 
 
 		 594 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2975  Acyl-CoA dehydrogenase  37.7 
 
 		 596 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0396  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.78 
 
 		 592 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6048  Acyl-CoA dehydrogenase-like  37.79 
 
 		 599 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4038  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase  39.55 
 
 		 595 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922091  normal  0.0585748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06640  putative acyl-CoA dehydrogenase  41.7 
 
 		 592 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0007  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.64 
 
 		 596 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.419421  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0197  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.75 
 
 		 595 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.908056  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2330  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.75 
 
 		 595 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0564  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.75 
 
 		 595 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2410  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.75 
 
 		 595 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1885  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.92 
 
 		 595 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.137162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0348  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.92 
 
 		 595 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06620  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.9 
 
 		 598 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.75 
 
 		 595 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0680  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.58 
 
 		 595 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0241  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.7 
 
 		 598 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4079  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.68 
 
 		 592 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2109  acyl-CoA dehydrogenase-like  38.09 
 
 		 595 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>