More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0527 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
204 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  81.77 
 
 
206 aa  338  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  78.71 
 
 
204 aa  324  6e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  76.96 
 
 
204 aa  323  9e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  79.21 
 
 
205 aa  320  8e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  80.2 
 
 
205 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  75.98 
 
 
204 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  75.49 
 
 
204 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  75.49 
 
 
204 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1491  TetR family transcriptional regulator  40.29 
 
 
209 aa  141  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 
241 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
239 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  37.2 
 
 
211 aa  121  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
253 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
239 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
239 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
239 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
239 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
239 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
239 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
247 aa  118  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
235 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  39.88 
 
 
237 aa  117  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 
236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 
239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 
244 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
220 aa  115  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 
252 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 
252 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 
252 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 
251 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 
251 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
222 aa  112  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  30.35 
 
 
231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01158  transcriptional regulator PhaD  33.68 
 
 
221 aa  106  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334041  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0551  transcriptional regulator, TetR family  51.49 
 
 
220 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0535  TetR family transcriptional regulator  51.49 
 
 
217 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0588697 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
215 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
215 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
215 aa  104  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
215 aa  104  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
225 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
215 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
221 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 
213 aa  102  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
227 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
211 aa  102  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
215 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 
215 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000936887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
215 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
215 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
215 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 
221 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  31.55 
 
 
220 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
221 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  31.88 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
221 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  28.37 
 
 
220 aa  99  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
215 aa  98.2  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  31.25 
 
 
220 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
245 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
218 aa  92  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
218 aa  91.7  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
217 aa  91.3  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  29.67 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  31.58 
 
 
211 aa  88.6  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  29.05 
 
 
214 aa  88.2  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
242 aa  82  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  34.06 
 
 
191 aa  72  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1089  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
213 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
196 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 
227 aa  59.3  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
220 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
332 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.373834 
 
 
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NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 
211 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 
187 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 
197 aa  55.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 
231 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal 
 
 
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NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
196 aa  55.1  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 
222 aa  54.7  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0267897 
 
 
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NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 
198 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  49.06 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
199 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  27.59 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.280342 
 
 
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NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
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