94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0522 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  72.91 
 
 
207 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  68.29 
 
 
208 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  68.29 
 
 
208 aa  266  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  68.02 
 
 
207 aa  265  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
207 aa  262  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  65.5 
 
 
207 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  65.5 
 
 
207 aa  258  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  69.19 
 
 
207 aa  258  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  64.97 
 
 
207 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  67.51 
 
 
207 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  28.43 
 
 
204 aa  111  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  28.43 
 
 
204 aa  111  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  33.85 
 
 
202 aa  98.6  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  33.5 
 
 
207 aa  98.6  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2018  hypothetical protein  28.86 
 
 
220 aa  91.3  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987101  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3416  hypothetical protein  30.96 
 
 
213 aa  85.5  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  31.68 
 
 
216 aa  84.7  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  26 
 
 
205 aa  84.7  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  25.5 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  29.25 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  24.49 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  30.08 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1187  Sterol-binding domain protein  28.43 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.044865  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0249  sterol-binding domain-containing protein  29.35 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.300084 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0174  Sterol-binding domain protein  29.44 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2701  hypothetical protein  22.16 
 
 
219 aa  59.7  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000952725 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  30.73 
 
 
206 aa  60.1  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3374  hypothetical protein  24.39 
 
 
207 aa  58.9  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.581541  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1099  sterol-binding domain-containing protein  28.27 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3552  hypothetical protein  26.9 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  23.74 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0444  Sterol-binding domain protein  26.52 
 
 
206 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3944  sterol-binding domain-containing protein  30.25 
 
 
216 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0404  hypothetical protein  28.33 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.459828  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0272  hypothetical protein  30.25 
 
 
210 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  22.64 
 
 
207 aa  55.5  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4355  hypothetical protein  24.74 
 
 
201 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.963397  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03727  hypothetical protein  24.74 
 
 
201 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4058  hypothetical protein  24.74 
 
 
201 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4174  sterol-binding domain-containing protein  24.74 
 
 
201 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890552 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1191  hypothetical protein  26.84 
 
 
215 aa  55.1  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4306  hypothetical protein  24.74 
 
 
201 aa  55.1  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03676  hypothetical protein  24.74 
 
 
201 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4145  Sterol-binding domain protein  24.74 
 
 
201 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3726  hypothetical protein  27.5 
 
 
206 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0460  hypothetical protein  26.02 
 
 
206 aa  55.1  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3914  Sterol-binding domain protein  25.89 
 
 
202 aa  55.1  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4217  hypothetical protein  24.74 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208427 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3762  Sterol-binding domain protein  28.02 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0418  hypothetical protein  25.76 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  23.68 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1895  hypothetical protein  33.64 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  28.73 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0430  sterol-binding domain-containing protein  25.76 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.493767  hitchhiker  0.0000569108 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0505  hypothetical protein  25 
 
 
206 aa  52.8  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0102  Sterol-binding domain protein  29.14 
 
 
211 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3640  hypothetical protein  28.4 
 
 
211 aa  52  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5275  hypothetical protein  23.96 
 
 
201 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0592137  normal  0.315828 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02770  hypothetical protein  28.93 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.763471  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3896  hypothetical protein  25.83 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  30.69 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  22.16 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4202  hypothetical protein  23.68 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0474  hypothetical protein  23.83 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0401  hypothetical protein  23.67 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4298  hypothetical protein  23.16 
 
 
201 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  28.49 
 
 
189 aa  48.9  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4251  hypothetical protein  23.68 
 
 
201 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4358  hypothetical protein  23.68 
 
 
201 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4179  hypothetical protein  23.68 
 
 
201 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0989  hypothetical protein  30.69 
 
 
193 aa  48.5  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3793  sterol-binding domain-containing protein  23.33 
 
 
207 aa  48.5  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4246  Sterol-binding domain protein  24.39 
 
 
207 aa  48.1  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0651  Sterol-binding domain protein  25 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4048  hypothetical protein  26.09 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.601005 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4200  hypothetical protein  23.48 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  29.08 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  26.04 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3493  putative lipid carrier protein-like protein  23.53 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4131  hypothetical protein  24.1 
 
 
206 aa  45.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000668989 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  23.88 
 
 
211 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4055  Sterol-binding domain protein  23.92 
 
 
213 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6057  hypothetical protein  25.54 
 
 
208 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0376  sterol-binding domain-containing protein  27.27 
 
 
214 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.340906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0373  hypothetical protein  28.77 
 
 
223 aa  45.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443261 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0555  hypothetical protein  26.8 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3203  hypothetical protein  24.62 
 
 
205 aa  43.9  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.663058  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  22.11 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  29.26 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2757  sterol-binding domain-containing protein  24.46 
 
 
208 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2730  hypothetical protein  24.46 
 
 
208 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.722232  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0569  hypothetical protein  25.95 
 
 
208 aa  42  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2118  hypothetical protein  24.46 
 
 
208 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>