More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0455 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 334 aa  669    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  75.93 
 
 		 331 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  75 
 
 		 331 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  75.31 
 
 		 331 aa  491  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  77.71 
 
 		 333 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  74.33 
 
 		 336 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  78.3 
 
 		 329 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  73.99 
 
 		 330 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  73.99 
 
 		 330 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  73.99 
 
 		 330 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  72.7 
 
 		 330 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  51.44 
 
 		 335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  46.63 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  37.81 
 
 		 305 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  38.6 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  37.54 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  37.55 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  38.25 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 339 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  34.42 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 327 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 		 328 aa  135  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  32.8 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  33.65 
 
 		 354 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 307 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  32.75 
 
 		 312 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  31.19 
 
 		 307 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 329 aa  112  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  31.3 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  33.69 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 324 aa  100  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  29.51 
 
 		 341 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 341 aa  94  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  29.68 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 341 aa  93.6  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  28.62 
 
 		 341 aa  93.6  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  28.82 
 
 		 341 aa  92.8  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  29.66 
 
 		 341 aa  90.1  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 340 aa  89.7  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  31.46 
 
 		 206 aa  85.1  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  31.47 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  30.9 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  34.85 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.37 
 
 		 207 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.09 
 
 		 420 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.09 
 
 		 207 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  33.57 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 326 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  28.25 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  37.5 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  31.65 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  27.68 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  45.45 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  26.97 
 
 		 219 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  38.78 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 124 aa  60.8  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.87 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0172  glycosyl transferase family protein  25.38 
 
 		 991 aa  60.1  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  39.25 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  42.42 
 
 		 119 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 120 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  43.28 
 
 		 123 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1390  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 137 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000534285  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  36.3 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  27.97 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  26.76 
 
 		 355 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  40.91 
 
 		 119 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  40.26 
 
 		 119 aa  57  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 		 265 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  30.26 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.58 
 
 		 229 aa  57  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  38.81 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.47 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>