More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0333 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  205  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  80 
 
 		 107 aa  152  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  63.11 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  62.77 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  67.03 
 
 		 94 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  57.73 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  65.22 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1085  ArsR family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0694077  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  55.88 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  63.92 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  61.62 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  64.13 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0937  ArsR family transcriptional regulator  55.34 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  55.34 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1900  ArsR family transcriptional regulator  55.34 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428282  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  65.48 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0445  ArsR family transcriptional regulator  55.34 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0202  ArsR family transcriptional regulator  55.34 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1814  ArsR family transcriptional regulator  55.34 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1404  ArsR family transcriptional regulator  55.34 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  64.84 
 
 		 117 aa  114  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  60.82 
 
 		 116 aa  114  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  61.05 
 
 		 116 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  58.95 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  58.7 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  70 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  60.44 
 
 		 109 aa  110  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  50.53 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  60.44 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  56.7 
 
 		 133 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  54.95 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 113 aa  106  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  67.95 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 107 aa  104  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 107 aa  104  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  51 
 
 		 109 aa  104  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  53.26 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  52.53 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  49.49 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  51.49 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  50.52 
 
 		 106 aa  100  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  49.48 
 
 		 117 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  50.55 
 
 		 115 aa  98.6  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 123 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 114 aa  98.6  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  61.04 
 
 		 110 aa  98.6  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  51.61 
 
 		 114 aa  98.2  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  51.65 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  50.51 
 
 		 227 aa  97.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  51.65 
 
 		 104 aa  97.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  48.96 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 127 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  49.48 
 
 		 117 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  48.96 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  54.44 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  47.37 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  51.65 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  51.61 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  53.33 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  56.58 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  47.13 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 119 aa  87.8  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  39.58 
 
 		 102 aa  88.2  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 115 aa  87.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4102  transcriptional regulator ArsR family  50.65 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00250446  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  49.47 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  39.22 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  45.65 
 
 		 105 aa  84.3  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  48.89 
 
 		 113 aa  84  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 101 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  48.24 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  47.13 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1527  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3220  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  47.13 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  37 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  40 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  39 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  39 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  41.67 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>