More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0325 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5260  peptidase M24  86.26 
 
 		 444 aa  769    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  87.16 
 
 		 444 aa  800    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5200  peptidase M24  85.59 
 
 		 444 aa  764    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  83.11 
 
 		 444 aa  763    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  100 
 
 		 444 aa  907    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  85.59 
 
 		 444 aa  765    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  85.14 
 
 		 444 aa  785    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  83.71 
 
 		 444 aa  761    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  86.49 
 
 		 444 aa  791    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5107  peptidase M24  85.59 
 
 		 444 aa  764    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  87.61 
 
 		 444 aa  803    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  68.35 
 
 		 439 aa  631  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3513  aminopeptidase P  65.75 
 
 		 439 aa  592  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135159  normal  0.871047 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  63.62 
 
 		 443 aa  588  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  61.43 
 
 		 454 aa  560  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  60.74 
 
 		 436 aa  549  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  60.05 
 
 		 437 aa  538  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  57.11 
 
 		 454 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3277  peptidase M24  57.47 
 
 		 442 aa  494  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.609187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  55.84 
 
 		 442 aa  486  1e-136  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02378  aminopeptidase P  55.18 
 
 		 446 aa  478  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0848  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain-containing protein  54.92 
 
 		 442 aa  475  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.283134  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0128  peptidase M24  52.53 
 
 		 440 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  51.24 
 
 		 446 aa  464  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  51.24 
 
 		 446 aa  464  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  51.04 
 
 		 436 aa  453  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  51.04 
 
 		 436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2334  putative XAA-Pro aminopeptidase  53.24 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3757  peptidase M24  51.03 
 
 		 435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.390253 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0432  aminopeptidase P  51.58 
 
 		 465 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386273  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  52.91 
 
 		 452 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1451  peptidase M24  52.61 
 
 		 447 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.582435  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0492  aminopeptidase P  53.88 
 
 		 474 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476859  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3502  peptidase M24  50.45 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0509  XAA-Pro aminopeptidase  50.55 
 
 		 458 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  49.31 
 
 		 443 aa  435  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  52.52 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3662  aminopeptidase P  52.79 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0400  peptidase M24  50.22 
 
 		 462 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.429272 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  51.6 
 
 		 437 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  50.68 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  50.68 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0385  peptidase M24  50 
 
 		 459 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  50.34 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  50.68 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  51.14 
 
 		 445 aa  431  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  50.11 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  49.89 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  50.11 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2146  aminopeptidase P  48.86 
 
 		 439 aa  426  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  50.11 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  50.68 
 
 		 438 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  50.11 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  50.68 
 
 		 438 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  50.11 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  49.66 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  49.66 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  50.57 
 
 		 437 aa  423  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2399  peptidase M24  46.77 
 
 		 435 aa  421  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  50 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  49.43 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  47.72 
 
 		 436 aa  422  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1873  peptidase M24  49.33 
 
 		 458 aa  424  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0588  peptidase M24  49.23 
 
 		 464 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  48.67 
 
 		 499 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  50.34 
 
 		 437 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0134  peptidase M24  49.08 
 
 		 439 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  50.34 
 
 		 437 aa  418  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5262  peptidase M24  48.93 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0614  peptidase M24  48.89 
 
 		 464 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  49.77 
 
 		 441 aa  421  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  50.34 
 
 		 437 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0131  peptidase M24  49.31 
 
 		 439 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.366962  decreased coverage  0.000000108006 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  47.8 
 
 		 439 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0623  aminopeptidase P  50.22 
 
 		 468 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920846  normal  0.361918 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2689  peptidase M24  48.32 
 
 		 461 aa  415  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2777  aminopeptidase P  47.84 
 
 		 436 aa  415  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  48.76 
 
 		 514 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0894  peptidase M24  50.68 
 
 		 449 aa  412  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00849  proline aminopeptidase P II  48.4 
 
 		 437 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0662  peptidase M24  49.44 
 
 		 461 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3781  aminopeptidase P  48.55 
 
 		 461 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0211  peptidase M24  49.44 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0695  peptidase M24  49.44 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0925  peptidase M24  48.91 
 
 		 460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6000  peptidase M24  48.83 
 
 		 441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  44.12 
 
 		 461 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4058  peptidase M24  46.41 
 
 		 473 aa  405  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  47.82 
 
 		 436 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3343  peptidase M24  48.18 
 
 		 414 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4829  aminopeptidase P  46.64 
 
 		 462 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3957  aminopeptidase P  50.11 
 
 		 721 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3399  aminopeptidase P  49.22 
 
 		 642 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612294  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0086  peptidase M24  47.6 
 
 		 469 aa  395  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2540  Xaa-Pro aminopeptidase  49.22 
 
 		 481 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0254  putative Xaa-Pro aminopeptidase (aminopeptidase P II) protein  47.46 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1135  Xaa-Pro aminopeptidase  49.22 
 
 		 481 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1254  Xaa-Pro aminopeptidase  48.89 
 
 		 611 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1577  peptidase M24  48.22 
 
 		 455 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0274  Xaa-Pro aminopeptidase  49.22 
 
 		 481 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>