More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0317 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 354 aa  699    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  73.91 
 
 		 357 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  70.91 
 
 		 358 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  74.2 
 
 		 382 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1433  secretion protein HlyD  67.37 
 
 		 358 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  57.22 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  57.22 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  57.22 
 
 		 355 aa  391  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  57.22 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  57.22 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  57.22 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  61.86 
 
 		 356 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  57.22 
 
 		 355 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  60.18 
 
 		 357 aa  388  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  61.56 
 
 		 357 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  58.07 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  58.36 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  58.36 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3789  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  58.36 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  58.36 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  60.47 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  59.14 
 
 		 352 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  58.05 
 
 		 467 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  61.14 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  61.96 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  59.1 
 
 		 359 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1685  secretion protein HlyD  60.34 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00216281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  57.22 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2632  putative efflux transporter, MFP subunit  62.5 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4916  secretion protein HlyD family protein  61.36 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1038  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  62.5 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2775  type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  62.5 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0439  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  61.61 
 
 		 357 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  56.36 
 
 		 356 aa  361  9e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0168  secretion protein HlyD  58.33 
 
 		 356 aa  360  1e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188471 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  58.12 
 
 		 357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4665  secretion protein HlyD  60.67 
 
 		 356 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  58.69 
 
 		 357 aa  352  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  57.93 
 
 		 358 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3661  HlyD family secretion protein  58.9 
 
 		 389 aa  349  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650458  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1351  HlyD family secretion protein  56.98 
 
 		 355 aa  348  7e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  59.04 
 
 		 357 aa  348  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1309  HlyD family secretion protein  56.98 
 
 		 391 aa  346  3e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0171  secretion protein HlyD  58.97 
 
 		 356 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1498  secretion protein HlyD family protein  61.16 
 
 		 356 aa  338  7e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2360  secretion protein HlyD family protein  61.16 
 
 		 356 aa  338  7e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.451322  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1152  secretion protein HlyD family protein  58.43 
 
 		 355 aa  322  6e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.162032  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4685  secretion protein HlyD family protein  56.53 
 
 		 429 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.189935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  51.71 
 
 		 332 aa  288  8e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  46.51 
 
 		 350 aa  282  6.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  45.72 
 
 		 365 aa  275  9e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  42.17 
 
 		 351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0748  secretion protein HlyD family protein  48.48 
 
 		 343 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0211  secretion protein HlyD family protein  46.18 
 
 		 331 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  42.2 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  44.69 
 
 		 339 aa  247  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  43.3 
 
 		 343 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  43.58 
 
 		 343 aa  246  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  44.76 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3791  secretion protein HlyD family protein  42.86 
 
 		 348 aa  243  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  43.06 
 
 		 341 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1310  hypothetical protein  71.7 
 
 		 161 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  42.68 
 
 		 334 aa  239  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0082  secretion protein HlyD family protein  44.22 
 
 		 437 aa  236  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  42.26 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  39.94 
 
 		 346 aa  232  7.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0986  secretion protein HlyD  42.99 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1560  secretion protein HlyD family protein  41.67 
 
 		 341 aa  230  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4846  secretion protein HlyD family protein  42.9 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.173931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  43.93 
 
 		 321 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3160  HlyD family membrane fusion protein  43.79 
 
 		 331 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3897  secretion protein HlyD family protein  43.48 
 
 		 331 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405047  normal  0.316887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5114  secretion protein HlyD family protein  44.34 
 
 		 319 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5206  secretion protein HlyD family protein  44.34 
 
 		 319 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5267  secretion protein HlyD family protein  44.04 
 
 		 319 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.777645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3217  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  43.79 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3969  MFP family transporter  51.28 
 
 		 284 aa  175  9e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5751  secretion protein HlyD family protein  35.21 
 
 		 332 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  31.52 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1311  hypothetical protein  56.2 
 
 		 195 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0096  secretion protein HlyD  33.53 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  28.8 
 
 		 371 aa  129  9.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  35.45 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  33.69 
 
 		 328 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  33.69 
 
 		 328 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  30.47 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  28.53 
 
 		 368 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  29.39 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  27.9 
 
 		 425 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  31.27 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  31.88 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  34.6 
 
 		 354 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  31.65 
 
 		 332 aa  113  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  31.19 
 
 		 350 aa  113  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  31.99 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  29.8 
 
 		 395 aa  112  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  32.5 
 
 		 333 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  31.7 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  33.94 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  28.11 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>