176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0292 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  70.66 
 
 		 636 aa  853    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  70.95 
 
 		 632 aa  887    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  72.74 
 
 		 632 aa  863    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  69.79 
 
 		 631 aa  855    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  68.85 
 
 		 633 aa  844    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  100 
 
 		 629 aa  1226    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  69.67 
 
 		 647 aa  844    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  66.93 
 
 		 652 aa  808    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  71.38 
 
 		 647 aa  856    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  43.24 
 
 		 645 aa  429  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  39.94 
 
 		 653 aa  414  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  38.99 
 
 		 653 aa  347  4e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  40.45 
 
 		 657 aa  346  8e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  40.44 
 
 		 647 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  37.52 
 
 		 637 aa  337  2.9999999999999997e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  38.32 
 
 		 664 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  36.32 
 
 		 642 aa  332  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  35.69 
 
 		 652 aa  327  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  37.82 
 
 		 652 aa  326  7e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  34.32 
 
 		 683 aa  319  9e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  36.35 
 
 		 642 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  36.35 
 
 		 642 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  35.96 
 
 		 640 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  36.56 
 
 		 644 aa  312  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  35.75 
 
 		 640 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  36.58 
 
 		 643 aa  300  4e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  37.46 
 
 		 649 aa  298  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2017  iron permease FTR1  34.56 
 
 		 413 aa  164  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00650927  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  30.83 
 
 		 572 aa  150  5e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1510  hypothetical protein  31.82 
 
 		 422 aa  140  8.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000353289  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  33.43 
 
 		 634 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  29.02 
 
 		 603 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  39.38 
 
 		 396 aa  134  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  29.38 
 
 		 679 aa  131  3e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  33.63 
 
 		 634 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  28.45 
 
 		 646 aa  127  6e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  33.87 
 
 		 660 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  34.52 
 
 		 639 aa  121  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  34.52 
 
 		 639 aa  120  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  34.52 
 
 		 639 aa  120  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  28.26 
 
 		 637 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0763  superoxide dismutase  27.01 
 
 		 647 aa  118  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.745778  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1170  iron permease, FTR1 family  29.03 
 
 		 691 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.900718  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  32.73 
 
 		 254 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1830  FTR1 family iron permease  30.12 
 
 		 696 aa  104  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2443  iron permease FTR1  33.33 
 
 		 399 aa  103  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2018  FTR1 family iron permease  31.06 
 
 		 696 aa  103  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1022  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  27.1 
 
 		 556 aa  102  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1649  FTR1 family iron permease  30.12 
 
 		 696 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0393  hypothetical protein  24.59 
 
 		 570 aa  99  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0403  hypothetical protein  24.59 
 
 		 570 aa  99  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5728  iron permease FTR1  31.12 
 
 		 846 aa  98.6  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0820  iron permease FTR1  28.86 
 
 		 782 aa  91.3  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.594209  hitchhiker  0.0000623566 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2435  iron permease FTR1  31.54 
 
 		 743 aa  90.1  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2692  iron permease FTR1  32.21 
 
 		 273 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4468  iron permease FTR1  29.26 
 
 		 779 aa  88.2  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390175  normal  0.0190609 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  36.44 
 
 		 254 aa  79.7  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0468  iron permease FTR1  30.7 
 
 		 820 aa  79  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402804  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  27.88 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  32.61 
 
 		 677 aa  73.9  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  30.64 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  30.74 
 
 		 290 aa  70.1  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  28.5 
 
 		 417 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  34.02 
 
 		 702 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  34.02 
 
 		 702 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  31.84 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2330  High-affinity Fe2+/Pb2+ permease-like protein  30.34 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00178906  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1954  iron permease FTR1  34.91 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.860822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  33.96 
 
 		 281 aa  67  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  30.58 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1936  iron permease FTR1  32.93 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480645 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  30.57 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  31.65 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0120  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  31.79 
 
 		 339 aa  63.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  27.96 
 
 		 579 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0101  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  33.81 
 
 		 329 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000967148 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  30.99 
 
 		 281 aa  63.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  29.73 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  30.19 
 
 		 279 aa  59.7  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  29.05 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  31.93 
 
 		 691 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  27.75 
 
 		 537 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  31.58 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  37.23 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3198  iron permease FTR1  27.19 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.521431  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  30.48 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2258  iron permease FTR1  33.47 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  28.97 
 
 		 279 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  28.97 
 
 		 276 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  30.88 
 
 		 281 aa  57  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  28.97 
 
 		 276 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  28.97 
 
 		 276 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  28.97 
 
 		 276 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  28.97 
 
 		 276 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  23.58 
 
 		 308 aa  57  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4136  cytochrome c class I  32.76 
 
 		 286 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  28.97 
 
 		 276 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  30.08 
 
 		 285 aa  55.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  30.33 
 
 		 278 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  28.57 
 
 		 290 aa  55.8  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>