More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0255 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  100 
 
 		 461 aa  892    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  62.17 
 
 		 460 aa  518  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  62.17 
 
 		 464 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0115  multidrug resistance protein NorM, putative  61.06 
 
 		 460 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6069  multidrug efflux protein NorA  63.27 
 
 		 462 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  62.11 
 
 		 462 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  62.56 
 
 		 462 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5172  multidrug efflux protein NorA  63.49 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69890  multidrug efflux protein NorA  63.04 
 
 		 488 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  63.27 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  36.04 
 
 		 470 aa  251  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  36.02 
 
 		 471 aa  249  6e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  36.02 
 
 		 471 aa  248  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  39.25 
 
 		 462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  39.02 
 
 		 462 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  38.2 
 
 		 468 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  39.18 
 
 		 463 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  39.72 
 
 		 470 aa  239  6.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  37.98 
 
 		 468 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  37.98 
 
 		 468 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  37.98 
 
 		 468 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  37.98 
 
 		 468 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  37.98 
 
 		 468 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  38.53 
 
 		 464 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  38.14 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  37.84 
 
 		 470 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  38.12 
 
 		 462 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  37.75 
 
 		 468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  36.89 
 
 		 467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  37.93 
 
 		 470 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  37.69 
 
 		 462 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  37.69 
 
 		 462 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  37.69 
 
 		 462 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1699  MATE efflux family protein  38.22 
 
 		 462 aa  231  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.4571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  35.02 
 
 		 465 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  39.15 
 
 		 474 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  38 
 
 		 472 aa  224  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  35.12 
 
 		 477 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  35.85 
 
 		 477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  35.85 
 
 		 477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0014  putative multidrug resistance protein norM  38.64 
 
 		 460 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  40.22 
 
 		 470 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  39.86 
 
 		 470 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  34.53 
 
 		 460 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  34.58 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  36.1 
 
 		 467 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  35.38 
 
 		 456 aa  215  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  35.41 
 
 		 466 aa  215  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  34.54 
 
 		 467 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  39.86 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  35.18 
 
 		 467 aa  210  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  34.15 
 
 		 457 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  35.24 
 
 		 460 aa  206  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0664  MATE efflux family protein  34.47 
 
 		 472 aa  204  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.253686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  29.42 
 
 		 454 aa  203  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  34.39 
 
 		 458 aa  203  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  36.54 
 
 		 451 aa  203  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0643  MATE efflux family protein  34.35 
 
 		 477 aa  203  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  32.42 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  36.54 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1146  MATE efflux family protein  39.24 
 
 		 469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.890459  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 451 aa  201  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0676  MATE efflux family protein  34.16 
 
 		 472 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.441843  normal  0.0136882 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  35.04 
 
 		 472 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  37.04 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  30.77 
 
 		 460 aa  196  8.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  31.94 
 
 		 459 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  32.17 
 
 		 461 aa  196  9e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  32.44 
 
 		 478 aa  195  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0033  MATE efflux family protein  34.67 
 
 		 463 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  29.67 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  29.67 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  29.42 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  31.88 
 
 		 459 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  29.37 
 
 		 460 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  29.67 
 
 		 453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  31.88 
 
 		 459 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  29.67 
 
 		 453 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  30.5 
 
 		 453 aa  189  8e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  31.42 
 
 		 459 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  30.28 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  30.28 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 458 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  28.38 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  31.65 
 
 		 459 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  31.51 
 
 		 459 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2247  Na+-driven multidrug efflux pump  31.71 
 
 		 464 aa  187  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  29.93 
 
 		 459 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  37.36 
 
 		 459 aa  186  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  32.07 
 
 		 457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  32.07 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  32.07 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  28.88 
 
 		 453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  33.03 
 
 		 486 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  31.63 
 
 		 457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  28.85 
 
 		 452 aa  183  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  31.02 
 
 		 456 aa  183  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  29.35 
 
 		 452 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  29.78 
 
 		 453 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  33.19 
 
 		 475 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>