40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0189 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0189  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 352 aa  674    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.511537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0204  flagellar hook-length control protein  38.93 
 
 		 361 aa  99.8  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.504865 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04953  flagellar hook-length control protein  45.45 
 
 		 351 aa  94.4  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0658  flagellar hook-length control protein  45.92 
 
 		 365 aa  93.6  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001169  flagellar hook-length control protein FliK  42.45 
 
 		 357 aa  92.8  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.272814  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0280  lateral flagellar hook length control protein LafE  47.62 
 
 		 353 aa  87  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00112639  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3354  flagellar hook-length control protein  46.43 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.26505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0231  flagellar hook-length control protein, putative  37.78 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3583  flagellar hook-length control protein  36.84 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0179  flagellar hook-length control protein, putative  36.3 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.501207  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0059  flagellar hook-length control protein  38.52 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0053  hypothetical protein  37.69 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3952  flagellar hook-length control protein  36.73 
 
 		 395 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253491  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3635  flagellar hook-length control protein  38.68 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.225852  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3451  flagellar hook-length control protein  36.03 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4663  flagellar hook-length control protein  39.33 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  34.31 
 
 		 686 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2354  flagellar hook-length control protein  28.08 
 
 		 487 aa  51.2  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  35.62 
 
 		 674 aa  51.2  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1989  flagellar hook-length control protein  30.77 
 
 		 394 aa  50.4  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3916  flagellar hook-length control protein  34.41 
 
 		 656 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108844 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1964  Flagellar hook-length control protein-like protein  31.25 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00976  flagellar protein  35.94 
 
 		 434 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06190  flagellar protein  35.94 
 
 		 434 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0480838  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1371  flagellar hook-length control protein  33.01 
 
 		 568 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.358506  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  33.33 
 
 		 623 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1186  putative flagellar hook-length control protein  34.88 
 
 		 580 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0493  flagellar hook-length control protein  35.53 
 
 		 460 aa  47.4  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3832  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 660 aa  47  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0575  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 552 aa  46.2  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3223  flagellar hook-length control protein FliK  33.33 
 
 		 527 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0416  hypothetical protein  30.69 
 
 		 479 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3888  hypothetical protein  30.85 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1623  flagellar hook-length control protein  28.35 
 
 		 544 aa  43.9  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2292  flagellar hook-length control protein FliK  30.48 
 
 		 593 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45830  hypothetical protein  30.85 
 
 		 427 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0047  flagellar hook-length control protein  29.41 
 
 		 482 aa  42.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1354  flagellar hook-length control protein  31.03 
 
 		 585 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1287  flagellar hook-length control protein  31.03 
 
 		 586 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1187  flagellar hook-length control protein  32.18 
 
 		 512 aa  42.7  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>