177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0187 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0187  flagellar protein FliS  100 
 
 		 132 aa  259  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.158957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0278  lateral flagellar chaperone protein LafC  57.6 
 
 		 130 aa  153  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00844444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3356  flagellar protein FliS  56 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.385304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0656  flagellar protein FliS  54.31 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4661  flagellar protein FliS  54.62 
 
 		 129 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.227103 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0177  flagellar protein FliS  54.17 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.711098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0229  flagellar protein FliS  53.33 
 
 		 128 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0206  flagellar protein FliS  53.45 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04955  flagellin-specific chaperone FliS  51.26 
 
 		 128 aa  127  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  45.97 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001171  flagellar biosynthesis protein FliS  51.26 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.329244  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0061  flagellar protein FliS  45.97 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3453  flagellar protein FliS  47.2 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3954  flagellar protein FliS  46.4 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0846761  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  37.4 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  38.02 
 
 		 136 aa  97.8  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  33.61 
 
 		 136 aa  93.6  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  35.25 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  33.61 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3082  flagellar protein FliS  36.75 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.699542  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  35.29 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3637  flagellar protein FliS  42.15 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2831  flagellar protein FliS  40 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161705  normal  0.0204753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  31.15 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  31.71 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  30.89 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  30.89 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  32.79 
 
 		 136 aa  87  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  31.93 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  31.71 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  35.77 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  36.07 
 
 		 140 aa  84.3  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  38.14 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0781  flagellar protein FliS  35.96 
 
 		 135 aa  83.6  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  38.14 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  38.14 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3585  flagellar protein FliS  30.65 
 
 		 126 aa  84  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  38.14 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  37.29 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1530  flagellar protein FliS  36.44 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0625  flagellar protein FliS  35.34 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1340  flagellar protein FliS  40 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  38.46 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  34.55 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  35.34 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1496  flagellar protein FliS  35.78 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0407266  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2524  flagellar protein FliS  36.13 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  38.46 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  37.21 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  37.6 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50250  flagellar protein FliS  40.5 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194402  decreased coverage  0.0000900366 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  37.82 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  41.23 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2197  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.71 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1291  hypothetical protein  29.91 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1290  hypothetical protein  30.77 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1492  flagellar protein FliS  37.39 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  30.63 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1952  flagellar protein FliS  34.75 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147939  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  34.19 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3463  flagellar protein FliS  35.59 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.220279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  36.44 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  35.04 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  36.44 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3567  flagellar protein FliS  30.58 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.530482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  33.9 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  35.54 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  33.9 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1055  flagellar protein FliS  35.65 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216537  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2160  flagellar protein FliS  35.65 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1714  flagellar protein FliS  35.65 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.16255 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2025  flagellar protein FliS  35.65 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2700  flagellar protein FliS  35.65 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.11516 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1256  flagellar protein FliS  35.65 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.25928 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  32.79 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4375  flagellar protein FliS  34.96 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.837168 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  27.27 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1446  flagellar protein FliS  30.71 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.431309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  33.06 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  35.96 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1012  flagellar protein FliS  37.29 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  26.05 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  31.9 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2864  flagellar protein  34.38 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.870438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  26.05 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1721  flagellar protein FliS  34.78 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.649676  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  32.48 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  38.68 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3107  flagellar protein FliS  33.9 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2973  flagellar protein FliS  33.9 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126092  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3059  flagellar protein FliS  35.59 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2911  flagellar protein FliS  36.46 
 
 		 275 aa  67  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.132531 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2948  flagellar protein FliS  33.9 
 
 		 162 aa  67  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  30.33 
 
 		 153 aa  66.6  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>