More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0137 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_0137  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
147 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71690  GNAT family acetyltransferase  73.29 
 
 
149 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0132  GCN5-related N-acetyltransferase  72.41 
 
 
146 aa  230  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6220  putative acetyltransferase  73.29 
 
 
149 aa  229  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1141  GCN5-related N-acetyltransferase  63.7 
 
 
149 aa  206  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5635  GCN5-related N-acetyltransferase  62.07 
 
 
148 aa  202  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013842  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5506  acetyltransferase, GNAT family  58.22 
 
 
148 aa  194  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5119  GCN5-related N-acetyltransferase  59.44 
 
 
148 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000288207  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5176  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  60.96 
 
 
335 aa  188  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.472651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5393  GCN5-related N-acetyltransferase  56.16 
 
 
148 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.650664  hitchhiker  0.00916992 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  58.74 
 
 
402 aa  183  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5344  acetyltransferase  54.79 
 
 
148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  54.11 
 
 
148 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5058  GCN5-related N-acetyltransferase  54.79 
 
 
148 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153522  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2785  GCN5-related N-acetyltransferase  57.82 
 
 
147 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2497  GCN5-related N-acetyltransferase  55.78 
 
 
147 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12144  normal  0.087022 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2964  GCN5-related N-acetyltransferase  55.1 
 
 
147 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0310  GCN5-related N-acetyltransferase  54.11 
 
 
154 aa  166  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132707  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4414  GCN5-related N-acetyltransferase  53.42 
 
 
413 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0279389  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3951  GCN5-related N-acetyltransferase  53.42 
 
 
413 aa  165  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  50.34 
 
 
148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0194  GCN5-related N-acetyltransferase  49.66 
 
 
153 aa  161  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  52.74 
 
 
414 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156281  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4519  GCN5-related N-acetyltransferase  52.74 
 
 
414 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5785  GCN5-related N-acetyltransferase  52.05 
 
 
400 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  54.55 
 
 
148 aa  159  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.771243  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1329  GCN5-related N-acetyltransferase  52.45 
 
 
414 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  49.33 
 
 
153 aa  157  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.624808  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7075  GCN5-related N-acetyltransferase  49.33 
 
 
153 aa  157  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4135  GCN5-related N-acetyltransferase  51.37 
 
 
399 aa  157  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0441895  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4113  GCN5-related N-acetyltransferase  52.32 
 
 
158 aa  156  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  51.68 
 
 
158 aa  156  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0193  putative acetyltransferase  50.34 
 
 
153 aa  156  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1954  GCN5-related N-acetyltransferase  51.35 
 
 
148 aa  155  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0219812  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3262  GCN5-related N-acetyltransferase  55.17 
 
 
148 aa  153  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2165  GCN5-related N-acetyltransferase  51.35 
 
 
148 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0161004  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4515  GCN5-related N-acetyltransferase  50.67 
 
 
155 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4647  GCN5-related N-acetyltransferase  50.67 
 
 
155 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20803  normal  0.0229692 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  50.68 
 
 
150 aa  150  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.806576 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5125  GCN5-related N-acetyltransferase  50.34 
 
 
158 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0836  GCN5-related N-acetyltransferase  45.21 
 
 
158 aa  144  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2917  GCN5-related N-acetyltransferase  47.65 
 
 
158 aa  143  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3851  GCN5-related N-acetyltransferase  45.33 
 
 
154 aa  141  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.619468  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  40.97 
 
 
152 aa  141  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
153 aa  137  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
152 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643013  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3002  GCN5-related N-acetyltransferase  43.54 
 
 
152 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533457  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1012  GCN5-related N-acetyltransferase  43.15 
 
 
152 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3351  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
152 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  43.15 
 
 
152 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3514  GCN5-related N-acetyltransferase  41.26 
 
 
152 aa  132  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2652  putative acetyltransferase  44.22 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1310  GCN5-related N-acetyltransferase  44.22 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939241  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09990  putative acetyltransferase  42.66 
 
 
152 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0175715  normal  0.714198 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3664  GCN5-related N-acetyltransferase  39.86 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671996  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60277  N-acetyltransferase HPA3  40.13 
 
 
154 aa  128  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.751079  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3469  GCN5-related N-acetyltransferase  48.28 
 
 
158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.293029  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3138  GCN5-related N-acetyltransferase  43.45 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2912  GCN5-related N-acetyltransferase  42.76 
 
 
145 aa  124  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.196361 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  38.3 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406329  normal  0.262902 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0274  GCN5-related N-acetyltransferase  40.14 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6192  GCN5-related N-acetyltransferase  44.83 
 
 
144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1882  putative acetyltransferase  43.36 
 
 
152 aa  116  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0785639  normal  0.209526 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1820  GCN5-related N-acetyltransferase  40.56 
 
 
148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2598  GCN5-related N-acetyltransferase  38.73 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2583  GCN5-related N-acetyltransferase  40.97 
 
 
151 aa  108  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0675931  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2683  GCN5-related N-acetyltransferase  39.58 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.454456  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0028  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 
147 aa  107  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.578829 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4251  Histone acetyl transferase protein  40.14 
 
 
150 aa  105  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4542  GCN5-related N-acetyltransferase  36.81 
 
 
149 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.3744 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1866  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
147 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.990958 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  39.04 
 
 
146 aa  103  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2987  acetyltransferase  38.1 
 
 
147 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.82546  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1633  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
147 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.499665  normal  0.357486 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  36.11 
 
 
147 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.701884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0311  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
148 aa  100  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126839  normal  0.150201 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3458  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 
153 aa  97.1  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.229516  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2017  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
146 aa  92  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059884  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1461  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
150 aa  87.8  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3036  GCN5-related N-acetyltransferase  45 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134438  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2444  acetyltransferase, GNAT family  33.11 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2356  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2540  GCN5-related N-acetyltransferase  31.16 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3406  acetyltransferase  29.41 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.344947 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3661  putative acetyltransferase  28.89 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.714516 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2450  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
159 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.0183751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0874  GCN5-related N-acetyltransferase  26.81 
 
 
149 aa  61.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0250  GNAT family acetyltransferase  35.96 
 
 
163 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.863666  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7133  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 
161 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3724  GCN5-related N-acetyltransferase  27.94 
 
 
160 aa  60.8  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  27.94 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 
157 aa  61.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2124  GCN5-related N-acetyltransferase  38.37 
 
 
159 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160054  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4651  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 
153 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.217746 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0882  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
165 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.922841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4130  GCN5-related N-acetyltransferase  26.28 
 
 
170 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1464  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
166 aa  59.7  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.975468  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5735  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77189  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>