164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0103 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  603  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  82.04 
 
 		 291 aa  487  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  80.14 
 
 		 291 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  77.82 
 
 		 289 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  77.82 
 
 		 289 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  56.3 
 
 		 290 aa  298  6e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1114  putative type VI secretion protein VasF  50 
 
 		 275 aa  255  6e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  45.41 
 
 		 430 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  44.4 
 
 		 438 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  44.4 
 
 		 438 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  44.4 
 
 		 438 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  44.4 
 
 		 438 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  44.4 
 
 		 438 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  44.4 
 
 		 438 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  44.4 
 
 		 438 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  44.4 
 
 		 437 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  43.97 
 
 		 440 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  41.1 
 
 		 413 aa  179  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  40 
 
 		 443 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  43.39 
 
 		 449 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  40.28 
 
 		 452 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  46.99 
 
 		 460 aa  172  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  42.98 
 
 		 449 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  43.69 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 		 429 aa  170  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  39.37 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  43.85 
 
 		 442 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  37.64 
 
 		 438 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  47.17 
 
 		 453 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 456 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  38.14 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  35.47 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  38.6 
 
 		 406 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  35.09 
 
 		 257 aa  148  9e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  35.09 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  38.39 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  37.95 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  35.92 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  35.92 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  37.5 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2119  hypothetical protein  35.92 
 
 		 289 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4081  hypothetical protein  35.44 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  hitchhiker  0.000110004 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  35.21 
 
 		 415 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  34.55 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0394  hypothetical protein  35.96 
 
 		 255 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  34.6 
 
 		 421 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  33.61 
 
 		 432 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  34.6 
 
 		 421 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0321  hypothetical protein  35.96 
 
 		 255 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  34.6 
 
 		 426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  34.6 
 
 		 421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  34.6 
 
 		 421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  34.6 
 
 		 421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  34.6 
 
 		 421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  32.42 
 
 		 434 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0230  hypothetical protein  39.88 
 
 		 253 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1103  Aec26  39.26 
 
 		 252 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1222  hypothetical protein  39.26 
 
 		 252 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.619966 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0238  hypothetical protein  39.88 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0232  hypothetical protein  39.26 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  34.55 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  33.82 
 
 		 282 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  34.3 
 
 		 282 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  34.27 
 
 		 430 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  37.1 
 
 		 433 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  34.91 
 
 		 436 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  37.24 
 
 		 434 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  36.73 
 
 		 434 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  36.73 
 
 		 434 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  36.73 
 
 		 434 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  34.8 
 
 		 429 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  33.92 
 
 		 434 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05851  hypothetical protein  30.8 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  30.97 
 
 		 431 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000429  ImpK/VasF outer membrane protein  33.33 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  31.8 
 
 		 443 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  30.9 
 
 		 447 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  36.56 
 
 		 433 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  36.56 
 
 		 433 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  36.56 
 
 		 433 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2558  hypothetical protein  32.85 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654353  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2859  hypothetical protein  32.85 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486796  normal  0.274768 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  29.49 
 
 		 469 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  31.98 
 
 		 494 aa  119  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  33.63 
 
 		 511 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1514  type IV / VI secretion system protein, DotU family  31.48 
 
 		 327 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568631  normal  0.950361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3047  type IV / VI secretion system protein, DotU family  35.88 
 
 		 489 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  33.64 
 
 		 458 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  33.64 
 
 		 458 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  34.12 
 
 		 414 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3034  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 487 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.047877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1182  putative type VI secretion protein VasF-1  33.13 
 
 		 374 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.29093  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  32.16 
 
 		 463 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  31.96 
 
 		 453 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2810  hypothetical protein  27.51 
 
 		 241 aa  97.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.442951  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4909  type IV / VI secretion system protein, DotU family  31.22 
 
 		 260 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0340153  normal  0.0265168 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3181  hypothetical protein  29.46 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.117699 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3486  OmpA family outer membrane protein  31.96 
 
 		 453 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.392072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3640  hypothetical protein  30.24 
 
 		 261 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00234142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3665  hypothetical protein  30.24 
 
 		 261 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>