58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0100 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_0100  FHA domain-containing protein  100 
 
 
398 aa  803    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5581  FHA domain-containing protein  66.08 
 
 
397 aa  508  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756831  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5422  FHA domain protein  66.92 
 
 
398 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42950  hypothetical protein  62.16 
 
 
397 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.171842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3607  hypothetical protein  63.18 
 
 
400 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1117  putative type VI secretion protein VasC  30.95 
 
 
453 aa  223  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2377  FHA domain-containing protein  25.44 
 
 
458 aa  133  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2320  FHA domain-containing protein  39.44 
 
 
480 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00351705  hitchhiker  0.00389608 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3483  hypothetical protein  28.57 
 
 
409 aa  96.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3127  FHA domain-containing protein  29.09 
 
 
409 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00194716  normal  0.0847804 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  38.74 
 
 
508 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00980  hypothetical protein  38.74 
 
 
319 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278124  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000012  uncharacterized protein ImpI/VasC  24.34 
 
 
397 aa  92  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  37.42 
 
 
470 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  26.91 
 
 
433 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00970  hypothetical protein  35.48 
 
 
180 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00615809  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2802  FHA domain containing protein  26.21 
 
 
409 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.824503  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0544  FHA domain containing protein  32.28 
 
 
554 aa  77  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3250  putative FHA domain containing protein  25 
 
 
406 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  34.97 
 
 
463 aa  74.3  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4064  FHA domain-containing protein  30.16 
 
 
580 aa  73.6  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000372597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1597  FHA domain-containing protein  31.58 
 
 
485 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177216  normal  0.583797 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  32.31 
 
 
541 aa  71.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2335  FHA domain-containing protein  32.98 
 
 
108 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26770  hypothetical protein  31.9 
 
 
565 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1075  FHA domain containing protein  24.75 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2456  FHA domain containing protein  31.76 
 
 
604 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.204622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1526  FHA domain-containing protein  34.94 
 
 
398 aa  67  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2846  FHA domain-containing protein  31.71 
 
 
478 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2971  FHA domain-containing protein  31.71 
 
 
477 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1210  FHA domain-containing protein  31.71 
 
 
478 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0442  FHA domain-containing protein  31.1 
 
 
478 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1773  FHA domain-containing protein  31.1 
 
 
478 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701606  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1588  FHA domain-containing protein  31.1 
 
 
478 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.786308  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0249  FHA domain-containing protein  30.86 
 
 
460 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0393  FHA domain-containing protein  31.1 
 
 
478 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.280068  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2355  FHA domain containing protein  28.26 
 
 
453 aa  63.5  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0208  FHA domain containing protein  29.38 
 
 
645 aa  63.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3841  FHA domain-containing protein  32.47 
 
 
681 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388095  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1468  FHA domain-containing protein  29.48 
 
 
777 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.637253  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05854  hypothetical protein  33.33 
 
 
504 aa  58.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3728  FHA domain-containing protein  31.19 
 
 
436 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2449  FHA domain-containing protein  34.03 
 
 
411 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.01697  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000432  uncharacterized protein ImpI/VasC  28.68 
 
 
497 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0026  hypothetical protein  27.51 
 
 
495 aa  53.5  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.498715  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1201  FHA domain-containing protein  27.59 
 
 
503 aa  53.5  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0241  hypothetical protein  21.41 
 
 
426 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0235  hypothetical protein  21.18 
 
 
426 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0233  hypothetical protein  21.18 
 
 
426 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1139  hypothetical protein  30.12 
 
 
299 aa  50.1  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1225  hypothetical protein  29.92 
 
 
428 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.728798 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1106  hypothetical protein  29.92 
 
 
428 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6044  forkhead-type phosphopeptide-binding protein  25 
 
 
419 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3229  FHA domain-containing protein  23.85 
 
 
189 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2122  FHA domain-containing protein  24.77 
 
 
189 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.47433  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2619  FHA domain-containing protein  24.77 
 
 
189 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0391  FHA domain-containing protein  28.23 
 
 
438 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0318  FHA domain-containing protein  28.23 
 
 
438 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>