More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0097 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  46.44 
 
 		 897 aa  702    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  46.52 
 
 		 889 aa  701    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0433  clpB protein, putative  52.94 
 
 		 875 aa  785    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3095  chaperone-associated ATPase, putative  47.8 
 
 		 878 aa  681    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3610  type VI secretion ATPase  77.49 
 
 		 875 aa  1305    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  45.9 
 
 		 916 aa  662    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000202411 
 
 
-
 
NC_003296  RS01959  putative CLPA/B-type chaperone protein  48.68 
 
 		 905 aa  716    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0804  type VI secretion ATPase  44.58 
 
 		 880 aa  655    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0162  type VI secretion ATPase  46.72 
 
 		 902 aa  691    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.475088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2548  clpB protein, putative  66.86 
 
 		 867 aa  1167    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5425  clpB protein, putative  78.6 
 
 		 882 aa  1352    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2520  type VI secretion ATPase  50.06 
 
 		 863 aa  760    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  46.52 
 
 		 889 aa  701    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  46.44 
 
 		 897 aa  702    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3129  ClpA/ClpB family protein  46.54 
 
 		 881 aa  671    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0229  type VI secretion ATPase  46.33 
 
 		 923 aa  685    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4958  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  49.69 
 
 		 867 aa  695    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1789  ATPase  47.1 
 
 		 884 aa  716    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2171  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  48.26 
 
 		 899 aa  716    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  45.42 
 
 		 898 aa  673    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141687  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  46.52 
 
 		 889 aa  701    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5260  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:phosphopantetheine attachment site  48.68 
 
 		 913 aa  705    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3644  type VI secretion ATPase  44.98 
 
 		 902 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.9184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0097  ATPase  100 
 
 		 866 aa  1727    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  46.52 
 
 		 889 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0237  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  46.78 
 
 		 923 aa  686    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1102  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  48.43 
 
 		 911 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0451  type VI secretion ATPase  47.05 
 
 		 889 aa  699    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2982  AAA family ATPase  45.09 
 
 		 880 aa  655    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00017738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5584  ClpB protein, putative  78.89 
 
 		 885 aa  1374    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  46.52 
 
 		 889 aa  701    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2366  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.77 
 
 		 904 aa  647    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266382 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2820  heat shock protein ClpB-like  45.79 
 
 		 899 aa  681    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3565  chaperonin clpA/B/, ATPase  46.53 
 
 		 889 aa  705    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0395  type VI secretion ATPase  48.06 
 
 		 867 aa  701    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26610  ClpA/B-type protease  46.84 
 
 		 886 aa  652    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526897  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2769  type VI secretion ATPase  48.31 
 
 		 865 aa  687    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186875  normal  0.804579 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3013  ATPase  45.96 
 
 		 887 aa  653    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02051  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  48.73 
 
 		 910 aa  729    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3315  AAA ATPase  53.85 
 
 		 878 aa  785    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1684  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  45.18 
 
 		 898 aa  648    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2627  ATPase  48.87 
 
 		 865 aa  673    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2958  ClpA/B type protease  46.58 
 
 		 887 aa  694    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2924  type VI secretion ATPase  46.82 
 
 		 889 aa  715    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1205  ATPase  46.65 
 
 		 873 aa  758    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5984  type VI secretion ATPase  44.44 
 
 		 909 aa  660    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0170  AAA family ATPase  45.54 
 
 		 882 aa  653    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000964396 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1536  fibronectin, type III  42.73 
 
 		 897 aa  661    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05872  ClpA/B type protease  50.89 
 
 		 894 aa  846    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1177  chaperone ClpB-1  42.61 
 
 		 872 aa  647    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1119  chaperone ClpB  56.1 
 
 		 872 aa  913    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135027  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3255  type VI secretion ATPase  45.38 
 
 		 884 aa  641    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1221  chaperone protein clpB  48.31 
 
 		 911 aa  690    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.362993 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2273  ATPase AAA-2  48.06 
 
 		 889 aa  687    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000450  ClpB protein  54.22 
 
 		 687 aa  721    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  45.63 
 
 		 900 aa  662    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0618  ATPase AAA-2  47.87 
 
 		 893 aa  711    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0224161 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0408  type VI secretion ATPase  47.25 
 
 		 889 aa  699    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4919  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  47.22 
 
 		 891 aa  702    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.989717  hitchhiker  0.00768481 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2505  type VI secretion ATPase  47.91 
 
 		 865 aa  702    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1079  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  47.87 
 
 		 865 aa  692    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0505801  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0322  type VI secretion ATPase  48.17 
 
 		 867 aa  704    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2505  AAA family ATPase  44.74 
 
 		 880 aa  657    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0231  ATP-dependent chaperone protein ClpB  46.43 
 
 		 919 aa  684    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0021  clpB protein  47.23 
 
 		 869 aa  708    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0732  type VI secretion ATPase  45.99 
 
 		 882 aa  659    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.759249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2362  ATPase  44.16 
 
 		 868 aa  658    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488644  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0387  ATPase  46.85 
 
 		 889 aa  699    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315602  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0530  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.79 
 
 		 909 aa  665    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01100  putative ClpA/B-type chaperone  46.61 
 
 		 902 aa  689    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2798  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  49.54 
 
 		 872 aa  736    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.425597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42980  putative ClpA/B-type protease  78.51 
 
 		 877 aa  1319    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172523  normal  0.0852173 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0473  ATPase  47.16 
 
 		 889 aa  701    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3069  ATPase  45.91 
 
 		 882 aa  673    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2449  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  45.59 
 
 		 869 aa  657    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258414  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3246  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  48.2 
 
 		 865 aa  709    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3724  ATPase  50.51 
 
 		 895 aa  783    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2954  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.34 
 
 		 888 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.400792  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3864  type VI secretion ATPase  45.29 
 
 		 928 aa  633  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  46.22 
 
 		 888 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3036  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  49.72 
 
 		 903 aa  634  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125208  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2632  ATPase AAA-2  52.38 
 
 		 681 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2829  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.22 
 
 		 888 aa  632  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1606  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46 
 
 		 884 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0409  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46 
 
 		 884 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0264  ClpA/B type protease  44.85 
 
 		 885 aa  626  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46 
 
 		 884 aa  625  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00259  ClpB  45.63 
 
 		 901 aa  624  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388989  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3118  ATPase  46.13 
 
 		 889 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0362166 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1789  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46 
 
 		 884 aa  625  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160275  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000027  ClpB protein  43.84 
 
 		 855 aa  625  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50860  AAA ATPase  47.14 
 
 		 842 aa  619  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1582  AAA ATPase, Clp  46.35 
 
 		 887 aa  619  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1474  type VI secretion ATPase  43.19 
 
 		 885 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1362  Clp protease-associated protein ClpB  43.19 
 
 		 885 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3412  ClpA/B-type protease  46.6 
 
 		 846 aa  616  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.219119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2696  Clp ATPase  43.08 
 
 		 891 aa  616  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310032  hitchhiker  0.00716242 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6693  type VI secretion ATPase  44.49 
 
 		 889 aa  619  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6115  type VI secretion ATPase  43.1 
 
 		 906 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0298  ClpV1 family type VI secretion ATPase  42.43 
 
 		 879 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.140659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>