62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0093 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  983    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  55.51 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13390  hypothetical protein  72.82 
 
 		 131 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.694836  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  71.7 
 
 		 174 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  63.81 
 
 		 172 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  60.38 
 
 		 165 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3930  hypothetical protein  27.38 
 
 		 506 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  65.17 
 
 		 181 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4128  PAAR  65.09 
 
 		 164 aa  113  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4633  hypothetical protein  56.31 
 
 		 177 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  54.37 
 
 		 179 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  57.55 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3257  hypothetical protein  24.68 
 
 		 550 aa  93.6  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.728074  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  49.46 
 
 		 379 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3756  hypothetical protein  50 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  56.25 
 
 		 87 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  56.25 
 
 		 87 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  56.25 
 
 		 87 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  44.33 
 
 		 96 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  41.41 
 
 		 100 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  45.26 
 
 		 96 aa  60.5  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  46.94 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  41.24 
 
 		 99 aa  59.3  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  43.16 
 
 		 113 aa  57.4  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  42.39 
 
 		 96 aa  57.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  48 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  48 
 
 		 87 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  40.21 
 
 		 98 aa  55.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  38.52 
 
 		 323 aa  54.3  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0368  PAAR repeat-containing protein  39.8 
 
 		 100 aa  53.9  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  41.58 
 
 		 540 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3584  PAAR repeat-containing protein  39.29 
 
 		 84 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  43.48 
 
 		 466 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  39.36 
 
 		 96 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  44.44 
 
 		 87 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 99 aa  51.6  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  44 
 
 		 456 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  39.18 
 
 		 99 aa  51.2  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  46.15 
 
 		 86 aa  50.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  46.3 
 
 		 88 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  38.46 
 
 		 592 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  40.23 
 
 		 102 aa  49.3  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  54.17 
 
 		 88 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3115  PAAR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 85 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3606  PAAR repeat-containing protein  44.05 
 
 		 96 aa  48.5  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0034  hypothetical protein  53.23 
 
 		 94 aa  47.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.543283  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2373  PAAR repeat-containing protein  38.3 
 
 		 96 aa  48.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0352022 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  34.32 
 
 		 456 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  45.28 
 
 		 88 aa  47.4  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1907  PAAR repeat-containing protein  46.38 
 
 		 93 aa  47  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142709  hitchhiker  0.000734481 
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  47.06 
 
 		 89 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  43.08 
 
 		 118 aa  46.2  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0895  hypothetical protein  45.45 
 
 		 89 aa  45.8  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.457574 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1039  PAAR  45.45 
 
 		 89 aa  45.8  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3238  PAAR repeat-containing protein  36.25 
 
 		 85 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3257  phospholipase  45.76 
 
 		 101 aa  45.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5383  PAAR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 93 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3019  hypothetical protein  31.25 
 
 		 84 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3252  PAAR repeat-containing protein  44.68 
 
 		 86 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0945  hypothetical protein  39.22 
 
 		 176 aa  44.3  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120455  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  30.56 
 
 		 1229 aa  43.5  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2610  hypothetical protein  35.8 
 
 		 85 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408788  normal  0.0150385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>