156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0090 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0090  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  331  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43040  hypothetical protein  82.14 
 
 		 168 aa  280  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.138878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5595  hypothetical protein  85.8 
 
 		 167 aa  279  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5433  hypothetical protein  82.82 
 
 		 168 aa  270  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3615  hypothetical protein  83.12 
 
 		 168 aa  270  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2543  hypothetical protein  73.46 
 
 		 166 aa  243  9e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0150995  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1124  putative type VI secretion protein VasQ  62.58 
 
 		 164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0278  hypothetical protein  53.75 
 
 		 162 aa  185  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1196  hypothetical protein  55.9 
 
 		 166 aa  183  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000441  uncharacterized protein ImpB  55.9 
 
 		 168 aa  181  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05863  hypothetical protein  54.66 
 
 		 168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3172  hypothetical protein  51.25 
 
 		 161 aa  174  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2807  type VI secretion protein, VC_A0107 family  55.13 
 
 		 167 aa  174  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3255  type VI secretion protein, VC_A0107 family  53.5 
 
 		 167 aa  174  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3733  hypothetical protein  54.04 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1070  type VI secretion protein, VC_A0107 family  52.87 
 
 		 167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.533436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2123  hypothetical protein  50.93 
 
 		 164 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2025  hypothetical protein  50.93 
 
 		 164 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2529  type VI secretion protein  48.73 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0744  hypothetical protein  50.31 
 
 		 164 aa  167  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0196457  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0533  hypothetical protein  50.31 
 
 		 164 aa  167  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.56183  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0604  hypothetical protein  50.31 
 
 		 164 aa  167  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0715  hypothetical protein  50.31 
 
 		 164 aa  167  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.750715  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1672  hypothetical protein  50.31 
 
 		 164 aa  167  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.873681  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0870  hypothetical protein  51.55 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0045  hypothetical protein  50.63 
 
 		 169 aa  160  9e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0239  hypothetical protein  45.91 
 
 		 166 aa  160  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0241  hypothetical protein  45.91 
 
 		 166 aa  160  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0247  hypothetical protein  45.51 
 
 		 166 aa  158  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.788284 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1231  type VI secretion protein  47.47 
 
 		 167 aa  157  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.137782 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0011  hypothetical protein  48.75 
 
 		 168 aa  157  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1111  type VI secretion protein, family  47.47 
 
 		 167 aa  157  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0386  type VI secretion protein  48.72 
 
 		 165 aa  154  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0313  hypothetical protein  48.72 
 
 		 165 aa  154  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3905  hypothetical protein  48.72 
 
 		 165 aa  154  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4074  hypothetical protein  50.63 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000649214  unclonable  0.000000799186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2127  hypothetical protein  50.64 
 
 		 167 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2624  hypothetical protein  50.64 
 
 		 167 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.799752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3224  type VI secretion protein  48.41 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1181  type VI secretion protein  47.1 
 
 		 161 aa  143  9e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0176  hypothetical protein  41.56 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.026937  hitchhiker  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0726  hypothetical protein  41.56 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2511  hypothetical protein  41.56 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2978  hypothetical protein  41.56 
 
 		 166 aa  121  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439438 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2600  type VI secretion protein  39.61 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0798  type VI secretion protein  39.61 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.153288  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0777  hypothetical protein  38.96 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3649  type VI secretion protein  41.72 
 
 		 170 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2814  hypothetical protein  41.01 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2916  hypothetical protein  35.44 
 
 		 165 aa  107  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.318874 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1783  hypothetical protein  37.41 
 
 		 165 aa  105  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5266  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0625  hypothetical protein  38.67 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3261  type VI secretion protein  36.36 
 
 		 167 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.30542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3025  hypothetical protein  41.84 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0474697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0031  hypothetical protein  53.85 
 
 		 103 aa  95.5  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.841066  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2369  hypothetical protein  37.91 
 
 		 166 aa  94.4  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3073  hypothetical protein  35.71 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.747125  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000020  uncharacterized protein ImpB  35 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100303  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1171  putative type VI secretion protein VasQ-1  33.33 
 
 		 169 aa  87.4  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0161  hypothetical protein  30.67 
 
 		 200 aa  87  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3123  hypothetical protein  30.71 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.489353  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3100  hypothetical protein  34.1 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2510  type VI secretion protein  35.29 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203105  normal  0.816356 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2622  hypothetical protein  34.1 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4953  hypothetical protein  34.64 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2764  type VI secretion protein  34.1 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0599499  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2964  EvpA  35.51 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1529  hypothetical protein  32.32 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0032  hypothetical protein  56.9 
 
 		 58 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.865838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3645  EvpA  34.78 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0328511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3635  hypothetical protein  34.78 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0300878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3660  hypothetical protein  34.78 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471211  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2268  hypothetical protein  30.77 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923124  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02045  EvpA  34 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.792135  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1733  hypothetical protein  31.08 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541869  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6051  hypothetical protein  31.06 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4913  type VI secretion protein, VC_A0107 family  33.33 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468167  normal  0.0151327 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0445  type VI secretion protein  34.06 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.493585  normal  0.482575 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3559  hypothetical protein  34.06 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00132458  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2639  hypothetical protein  34.06 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00139416  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34070  hypothetical protein  36.29 
 
 		 181 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0502886  normal  0.0617525 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0467  hypothetical protein  34.06 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00157357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2896  hypothetical protein  36.29 
 
 		 181 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2930  type VI secretion protein  34.06 
 
 		 171 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00592536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2360  type VI secretion protein, VC_A0107 family  38.32 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0381  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00433333  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0402  type VI secretion protein  33.33 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000194603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2177  hypothetical protein  33.55 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024001  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01965  hypothetical protein  29.75 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.380992  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1207  type VI secretion protein, VC_A0107 family  31.21 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5978  type VI secretion protein  33.87 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.785874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3041  type VI secretion protein, VC_A0107 family  31.91 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3043  type VI secretion protein, VC_A0107 family  29.79 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0121  hypothetical protein  28.99 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1605  hypothetical protein  28.99 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.350128  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50800  hypothetical protein  33.06 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0157  hypothetical protein  28.99 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0133  hypothetical protein  28.99 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3406  hypothetical protein  33.87 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>