More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0064 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  82.63 
 
 		 505 aa  868    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  77.05 
 
 		 501 aa  822    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  76.45 
 
 		 501 aa  821    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  81.12 
 
 		 503 aa  842    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  78.04 
 
 		 510 aa  827    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  83.03 
 
 		 505 aa  870    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  82.24 
 
 		 505 aa  864    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  80.92 
 
 		 503 aa  827    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  100 
 
 		 502 aa  1039    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  82.83 
 
 		 505 aa  870    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  68.56 
 
 		 594 aa  617  1e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  56.31 
 
 		 518 aa  600  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  57.4 
 
 		 513 aa  591  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  57.73 
 
 		 516 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  57.51 
 
 		 517 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  57.51 
 
 		 522 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  57.51 
 
 		 511 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  57.53 
 
 		 516 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  57.53 
 
 		 516 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  57.53 
 
 		 516 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  57.51 
 
 		 522 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  57.51 
 
 		 522 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  57.51 
 
 		 522 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  57.51 
 
 		 517 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  57.51 
 
 		 522 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  57.11 
 
 		 517 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  56.3 
 
 		 512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  58.3 
 
 		 511 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  56.45 
 
 		 515 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  57.91 
 
 		 511 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  53.37 
 
 		 509 aa  537  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  47.82 
 
 		 502 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  48.41 
 
 		 502 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  48.02 
 
 		 504 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  48.71 
 
 		 501 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  48.51 
 
 		 498 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  47.12 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  49.9 
 
 		 503 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  46.92 
 
 		 501 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  46.83 
 
 		 502 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  46.95 
 
 		 512 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  47.69 
 
 		 496 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  46.93 
 
 		 504 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  44.95 
 
 		 520 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  35.14 
 
 		 489 aa  236  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  30.23 
 
 		 482 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  29.37 
 
 		 526 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  31.39 
 
 		 535 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  30.32 
 
 		 476 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  30.6 
 
 		 497 aa  161  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  29.14 
 
 		 586 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  31.52 
 
 		 496 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  28.29 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  29.4 
 
 		 572 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  29.8 
 
 		 499 aa  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  27.92 
 
 		 549 aa  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  25.27 
 
 		 473 aa  144  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  27.52 
 
 		 497 aa  143  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4043  sulfatase  28.49 
 
 		 497 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  27.55 
 
 		 497 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28950  arylsulfatase A family protein  27.57 
 
 		 489 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  29.07 
 
 		 483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  27.08 
 
 		 497 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  27.08 
 
 		 497 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  27.08 
 
 		 497 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  30.27 
 
 		 497 aa  140  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  29.69 
 
 		 478 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  24.41 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  27.37 
 
 		 508 aa  137  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  28.61 
 
 		 535 aa  136  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  28.22 
 
 		 479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  28.39 
 
 		 487 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  26.59 
 
 		 511 aa  134  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  25.17 
 
 		 537 aa  133  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  27.37 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  29.05 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0357  sulfatase  25 
 
 		 491 aa  131  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  31.43 
 
 		 523 aa  131  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  27.82 
 
 		 523 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  27.29 
 
 		 471 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  25.5 
 
 		 481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  28.26 
 
 		 536 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  25.21 
 
 		 501 aa  127  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  29.92 
 
 		 480 aa  127  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  27.47 
 
 		 453 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  26.75 
 
 		 565 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  26.43 
 
 		 517 aa  125  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3468  sulfatase  30.13 
 
 		 466 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  26.3 
 
 		 467 aa  124  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  30.08 
 
 		 489 aa  124  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  26.03 
 
 		 500 aa  123  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  27.62 
 
 		 518 aa  123  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  26.68 
 
 		 482 aa  123  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  25.7 
 
 		 486 aa  123  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  26.77 
 
 		 491 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  26.24 
 
 		 502 aa  121  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  26.42 
 
 		 497 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  33.75 
 
 		 554 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  26.18 
 
 		 519 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  25.49 
 
 		 510 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>