More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0062 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  68.4 
 
 		 522 aa  644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  69.17 
 
 		 522 aa  652    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  69.6 
 
 		 522 aa  687    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0062  sulphate transporter  100 
 
 		 546 aa  1063    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  65.5 
 
 		 521 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0075  sulphate transporter  64.93 
 
 		 521 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103886  hitchhiker  0.00048278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0094  sulphate transporter  64.75 
 
 		 521 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317812  hitchhiker  0.000091476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  61.87 
 
 		 517 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0091  sulphate transporter  65.32 
 
 		 521 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00340  putative sulfate transporter  63.04 
 
 		 517 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0788781 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  41.36 
 
 		 584 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  39.51 
 
 		 626 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  43.02 
 
 		 620 aa  363  4e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  43.19 
 
 		 577 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  39.02 
 
 		 603 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  39.36 
 
 		 608 aa  352  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  40.61 
 
 		 603 aa  339  9e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  40.78 
 
 		 599 aa  331  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  39.37 
 
 		 730 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  39.62 
 
 		 711 aa  306  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4099  sulphate transporter  38.55 
 
 		 620 aa  295  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  32.61 
 
 		 580 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  38.67 
 
 		 590 aa  276  8e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  36.4 
 
 		 703 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  32.33 
 
 		 573 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  39.35 
 
 		 711 aa  272  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4885  sulphate transporter  44.1 
 
 		 698 aa  269  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  34.75 
 
 		 729 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0442  sulphate transporter  42.28 
 
 		 584 aa  261  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  34.42 
 
 		 588 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  35.43 
 
 		 588 aa  250  6e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  34.63 
 
 		 703 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  36.36 
 
 		 584 aa  243  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  30.95 
 
 		 574 aa  242  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0425  sulfate transporter  38.43 
 
 		 601 aa  239  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  34.78 
 
 		 591 aa  237  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  32.11 
 
 		 585 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  30.77 
 
 		 578 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  34 
 
 		 572 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  32.19 
 
 		 574 aa  219  7.999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  28.99 
 
 		 588 aa  219  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  32.1 
 
 		 558 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1689  sulphate transporter  30.14 
 
 		 605 aa  212  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  33.6 
 
 		 590 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  32.2 
 
 		 585 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  31.97 
 
 		 605 aa  205  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  32.28 
 
 		 588 aa  200  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  28.15 
 
 		 571 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2846  sulphate transporter  31.39 
 
 		 604 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.145004 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  32.09 
 
 		 584 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  29.87 
 
 		 583 aa  196  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  31.15 
 
 		 592 aa  195  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  29.41 
 
 		 583 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  28.23 
 
 		 579 aa  192  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  29.57 
 
 		 578 aa  191  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  30.58 
 
 		 575 aa  190  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  29.89 
 
 		 597 aa  190  5.999999999999999e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  31 
 
 		 570 aa  190  7e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  27.92 
 
 		 585 aa  189  8e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  27.75 
 
 		 569 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  32.88 
 
 		 581 aa  189  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  27.75 
 
 		 569 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  27.68 
 
 		 570 aa  186  8e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  28.52 
 
 		 592 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  30.04 
 
 		 563 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  28.49 
 
 		 585 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  28.68 
 
 		 585 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  31.12 
 
 		 586 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  30.87 
 
 		 563 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  29.38 
 
 		 573 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  28.49 
 
 		 585 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  30.77 
 
 		 586 aa  184  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  27.55 
 
 		 585 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  27.55 
 
 		 585 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  27.55 
 
 		 585 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  27.55 
 
 		 585 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  28.03 
 
 		 590 aa  183  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  28.68 
 
 		 606 aa  183  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  26.25 
 
 		 545 aa  183  9.000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  29.45 
 
 		 570 aa  182  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  29.93 
 
 		 571 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  29.08 
 
 		 565 aa  180  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3553  putative sulfate transporter YchM  29.71 
 
 		 588 aa  180  7e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  30.54 
 
 		 552 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002776  putative sulfate permease  26.48 
 
 		 591 aa  179  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.408256  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1630  sulphate transporter  29.11 
 
 		 600 aa  179  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  30.39 
 
 		 568 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  30.39 
 
 		 568 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1620  sulfate transporter  30.59 
 
 		 582 aa  178  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1136  sulfate transporter  26.83 
 
 		 572 aa  177  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3713  sulphate transporter  27.45 
 
 		 576 aa  178  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.85263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  30.2 
 
 		 568 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  30.91 
 
 		 555 aa  177  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  26.54 
 
 		 558 aa  177  5e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  28.86 
 
 		 573 aa  177  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2174  putative sulfate transporter YchM  31.4 
 
 		 565 aa  176  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2454  putative sulfate transporter YchM  31.4 
 
 		 565 aa  176  7e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2061  putative sulfate transporter YchM  31.4 
 
 		 565 aa  176  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  27.86 
 
 		 553 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1138  putative sulfate transporter YchM  29.86 
 
 		 587 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>