More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0039 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1402  type III secretion protein HrcV  78.29 
 
 		 695 aa  1117    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1215  Type III secretion protein HrcV  79.29 
 
 		 695 aa  1128    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141393  normal  0.819529 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2206  type III secretion protein, HrcV family  63.4 
 
 		 700 aa  866    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0039  HrcV family type III secretion protein  100 
 
 		 694 aa  1402    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1891  type III secretion protein, HrcV family  64.33 
 
 		 700 aa  870    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01736  Type III secretory pathway, component EscV  41.04 
 
 		 705 aa  535  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0035  type III secretion protein LcrD  42.01 
 
 		 704 aa  525  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003372  Type III secretion inner membrane channel protein  40.76 
 
 		 705 aa  526  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2273  secretion system apparatus protein SsaV  42.03 
 
 		 685 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660875  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1969  secretion system apparatus protein SsaV  41.02 
 
 		 685 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3819  secretion system apparatus protein SsaV  41.19 
 
 		 682 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42500  type III secretory apparatus protein PcrD  41.04 
 
 		 706 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3907  secretion system apparatus protein SsaV  41.19 
 
 		 682 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5063  type III secretion protein, HrcV family  37.52 
 
 		 675 aa  452  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.34381 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3008  HrcV family type III secretion protein  38.45 
 
 		 697 aa  445  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.181145  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2415  type III secretion protein, HrcV family  38.47 
 
 		 696 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5931  HrcV family type III secretion protein  39.5 
 
 		 684 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878766  normal  0.0843176 
 
 
-
 
NC_002620  TC0365  type III secretion inner membrane protein SctV  35.35 
 
 		 708 aa  425  1e-117  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.371856  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1630  type III secretion inner membrane protein SctV  38.52 
 
 		 690 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305516  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2281  HrcV family type III secretion protein  38.52 
 
 		 690 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1955  type III secretion inner membrane protein SctV  38.52 
 
 		 690 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0635  type III secretion inner membrane protein SctV  38.52 
 
 		 690 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0181  MxiA  38.62 
 
 		 686 aa  425  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.317085  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2198  HrcV family type III secretion protein  38.52 
 
 		 690 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.461572  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4147  type III secretion protein, HrcV family  36.17 
 
 		 686 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033977 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0679  type III secretion inner membrane protein SctV  38.12 
 
 		 1327 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1929  secretion system apparatus protein SsaV  38.54 
 
 		 681 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.401971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1510  secretion system apparatus protein SsaV  38.54 
 
 		 681 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113276  normal  0.87404 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1525  secretion system apparatus protein SsaV  38.54 
 
 		 681 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1759  secretion system apparatus protein SsaV  38.39 
 
 		 681 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0357645  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1547  secretion system apparatus protein SsaV  38.54 
 
 		 681 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0751  type III secretion inner membrane protein SctV  37.85 
 
 		 690 aa  416  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.531496  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3206  invasion protein InvA  37.59 
 
 		 685 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3018  invasion protein InvA  37.45 
 
 		 685 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3049  invasion protein InvA  37.45 
 
 		 685 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.459532  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3101  invasion protein InvA  37.45 
 
 		 685 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.758436  hitchhiker  0.000000202364 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3086  invasion protein InvA  37.45 
 
 		 685 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5641  HrcV family type III secretion protein  38.75 
 
 		 658 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335669  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5858  HrcV family type III secretion protein  38.45 
 
 		 658 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.34 
 
 		 695 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0428  SctV  37.29 
 
 		 705 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489675  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1997  HrcV family type III secretion protein  37.29 
 
 		 705 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0837428  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1905  HrcV family type III secretion protein  37.29 
 
 		 705 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0863  Hrp conserved HRCV transmembrane protein  36.99 
 
 		 690 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860177 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.3 
 
 		 695 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0452  HrcV family type III secretion protein  37.54 
 
 		 687 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0695404  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.34 
 
 		 702 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0830  type III secretion system protein BsaQ  36.45 
 
 		 702 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00148926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.12 
 
 		 694 aa  382  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.53 
 
 		 697 aa  378  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.72 
 
 		 696 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.53 
 
 		 692 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.78 
 
 		 692 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2085  HrcV family type III secretion protein  36.35 
 
 		 690 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2173  HrcV family type III secretion protein  36.35 
 
 		 690 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.324118  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1542  type III secretion system protein BsaQ  36.35 
 
 		 690 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.516262  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0742  type III secretion system protein BsaQ  36.35 
 
 		 690 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0433938  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0584  type III secretion system protein BsaQ  36.35 
 
 		 690 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000770866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.52 
 
 		 694 aa  375  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.65 
 
 		 690 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.82 
 
 		 703 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.84 
 
 		 686 aa  373  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2062  type III secretion system protein BsaQ  36.35 
 
 		 690 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.287404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.96 
 
 		 692 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.19 
 
 		 699 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.06 
 
 		 699 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.68 
 
 		 693 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.67 
 
 		 700 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.8 
 
 		 697 aa  371  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.7 
 
 		 699 aa  372  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.41 
 
 		 690 aa  372  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0119  type III secretion FHIPEP  35.64 
 
 		 691 aa  372  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.08 
 
 		 692 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.08 
 
 		 697 aa  369  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03403  HrcV  37.48 
 
 		 628 aa  369  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.16 
 
 		 680 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.41 
 
 		 699 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.41 
 
 		 699 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0869  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.23 
 
 		 686 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0739  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.54 
 
 		 681 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  35 
 
 		 699 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.14 
 
 		 694 aa  368  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.14 
 
 		 694 aa  368  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.05 
 
 		 693 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2158  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.43 
 
 		 690 aa  365  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.31 
 
 		 699 aa  365  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5428  type III secretion FHIPEP protein  35.98 
 
 		 738 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.158228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.26 
 
 		 699 aa  364  4e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.21 
 
 		 689 aa  363  6e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.25 
 
 		 699 aa  363  6e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.21 
 
 		 710 aa  363  7.0000000000000005e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4753  type III secretion FHIPEP protein  35.73 
 
 		 734 aa  363  8e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.936418 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3707  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.86 
 
 		 693 aa  362  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306788  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3739  type III secretion FHIPEP protein  35.92 
 
 		 729 aa  362  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728241 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.76 
 
 		 698 aa  361  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06205  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.87 
 
 		 684 aa  360  3e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.127059  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00961  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.87 
 
 		 684 aa  360  3e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.21205  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.01 
 
 		 699 aa  360  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3510  type III secretion FHIPEP  35.5 
 
 		 739 aa  361  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4856  type III secretion FHIPEP protein  35.5 
 
 		 739 aa  361  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>