More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0036 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0637  ISPpu15, transposase Orf2  70 
 
 		 510 aa  759    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3114  ISPpu13, transposase Orf2  72.12 
 
 		 510 aa  793    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90064  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4114  transposase IS66  98.85 
 
 		 520 aa  978    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3985  ISPpu13, transposase Orf2  72.12 
 
 		 510 aa  793    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.757297  hitchhiker  0.00792894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4025  ISPpu15, transposase Orf2  70 
 
 		 510 aa  759    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4091  ISPpu15, transposase Orf2  70.19 
 
 		 510 aa  761    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0162386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4745  ISPpu15, transposase Orf2  70 
 
 		 510 aa  759    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.551625  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0035  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.701861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0039  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0196  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.904246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0670  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1020  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1098  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1189  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633516  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1227  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2437  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.713289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2460  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2840  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0352443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2971  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3213  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3216  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.727249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3220  ISPsy5, transposase  70.58 
 
 		 503 aa  771    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.221861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3613  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3651  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3996  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222693  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3999  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00912569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4251  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4389  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4567  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4693  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4737  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4764  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4994  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5212  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5215  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5304  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5368  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5411  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5443  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5445  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5543  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5591  ISPsy5, transposase  68.88 
 
 		 517 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0036  transposase IS66  100 
 
 		 524 aa  1070    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1988  transposase IS66  98.85 
 
 		 520 aa  978    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1548  transposase IS66  98.85 
 
 		 520 aa  978    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.446339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1163  transposase IS66  98.85 
 
 		 520 aa  978    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230902  normal  0.467895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0431  transposase IS66  98.85 
 
 		 520 aa  978    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0160  transposase IS66  99.05 
 
 		 522 aa  979    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0434  transposase IS66  98.85 
 
 		 520 aa  978    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.543739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1719  transposase IS66  70.41 
 
 		 506 aa  762    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.702381  hitchhiker  0.0000463056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4792  transposase IS66  70.41 
 
 		 506 aa  762    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0522  transposase IS66  70.41 
 
 		 506 aa  762    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3084  transposase IS66  98.85 
 
 		 520 aa  978    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.280234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1050  transposase IS66  98.85 
 
 		 520 aa  978    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3638  transposase IS66  98.85 
 
 		 520 aa  978    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1003  transposase IS66  55.73 
 
 		 581 aa  536  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1616  transposase IS66  55.73 
 
 		 581 aa  536  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.772385  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  51.9 
 
 		 694 aa  491  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  51.9 
 
 		 530 aa  489  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  51.9 
 
 		 530 aa  489  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2620  transposase IS66  48.39 
 
 		 515 aa  473  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0332564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2650  transposase IS66  48.39 
 
 		 515 aa  473  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.956476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1984  transposase IS66  48.2 
 
 		 526 aa  459  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2184  transposase IS66  48.2 
 
 		 526 aa  459  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000882375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3292  transposase IS66  48.2 
 
 		 526 aa  458  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.118311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0321  transposase IS66  48.2 
 
 		 526 aa  458  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000571248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0474  transposase IS66  48.2 
 
 		 526 aa  458  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.330634 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0656  transposase IS66  48.2 
 
 		 526 aa  458  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.762551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0662  transposase IS66  48.2 
 
 		 526 aa  458  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0971394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0677  transposase IS66  48.2 
 
 		 526 aa  458  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1790  transposase IS66  48.2 
 
 		 526 aa  458  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0368561  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1976  transposase IS66  48.2 
 
 		 526 aa  458  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.212724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2190  transposase IS66  48.2 
 
 		 526 aa  458  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1274  transposase IS66  54.23 
 
 		 606 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0129566 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2630  transposase IS66  47.44 
 
 		 526 aa  450  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00176311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2663  transposase IS66  47.44 
 
 		 526 aa  450  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2632  transposase IS66  47.36 
 
 		 488 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0406553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3056  transposase IS66  44.49 
 
 		 529 aa  394  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4534  transposase IS66  46.39 
 
 		 532 aa  383  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3092  transposase IS66  45.09 
 
 		 531 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2521  transposase IS66  45.58 
 
 		 536 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.538642  normal  0.424177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1412  transposase IS66  45.09 
 
 		 531 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0236  transposase  41.68 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1280  transposase  41.68 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.653734  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0437  transposase  41.68 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1656  transposase  41.68 
 
 		 495 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.413998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1293  transposase  41.68 
 
 		 495 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185567  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0115  transposase  41.68 
 
 		 495 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1205  transposase  41.68 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1664  transposase  41.68 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1576  transposase  41.68 
 
 		 495 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0144  transposase  41.68 
 
 		 495 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1442  transposase  41.68 
 
 		 495 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612647  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0811  transposase  41.68 
 
 		 495 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.973056  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1417  transposase  41.68 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0291  transposase  41.68 
 
 		 495 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1780  transposase  41.68 
 
 		 495 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.175929  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0214  transposase  41.68 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6840  transposase IS66  44.11 
 
 		 518 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0783  transposase  41.68 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00157857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>