182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0035 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3085  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 360 bp  714    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.325367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0432  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 360 bp  714    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1549  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 360 bp  714    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.555012  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3637  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 360 bp  714    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4114  transposase IS66  99.24 
 
 		 1563 bp  3041    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0161  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 360 bp  714    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0106398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1163  transposase IS66  99.24 
 
 		 1563 bp  3041    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230902  normal  0.467895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1049  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 360 bp  714    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0743171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1989  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 360 bp  714    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.228694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1164  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 360 bp  714    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0832363  normal  0.259403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3638  transposase IS66  99.24 
 
 		 1563 bp  3041    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4115  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 360 bp  714    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0036  transposase IS66  100 
 
 		 1575 bp  3122    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0035    100 
 
 		 2622 bp  5198    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0160  transposase IS66  99.62 
 
 		 1569 bp  3077    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0434  transposase IS66  99.24 
 
 		 1563 bp  3041    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.543739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0431  transposase IS66  99.24 
 
 		 1563 bp  3041    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0037  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 360 bp  714    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1050  transposase IS66  99.24 
 
 		 1563 bp  3041    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0435  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 360 bp  714    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.566567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1548  transposase IS66  99.24 
 
 		 1563 bp  3041    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.446339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3084  transposase IS66  99.24 
 
 		 1563 bp  3041    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.280234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1988  transposase IS66  99.24 
 
 		 1563 bp  3041    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3220  ISPsy5, transposase  79.25 
 
 		 1512 bp  280  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.221861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3114  ISPpu13, transposase Orf2  79.16 
 
 		 1533 bp  266  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90064  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3985  ISPpu13, transposase Orf2  79.16 
 
 		 1533 bp  266  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.757297  hitchhiker  0.00792894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0522  transposase IS66  77.9 
 
 		 1521 bp  190  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4792  transposase IS66  77.9 
 
 		 1521 bp  190  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1719  transposase IS66  77.9 
 
 		 1521 bp  190  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.702381  hitchhiker  0.0000463056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1165  hypothetical protein  100 
 
 		 348 bp  168  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal  0.18975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1550  hypothetical protein  100 
 
 		 267 bp  168  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.358293  normal  0.656053 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3636  D-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 1773 bp  168  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0433  IS66 Orf2 family protein  90.55 
 
 		 339 bp  157  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4091  ISPpu15, transposase Orf2  79.06 
 
 		 1533 bp  151  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0162386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0637  ISPpu15, transposase Orf2  78.85 
 
 		 1533 bp  143  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4025  ISPpu15, transposase Orf2  78.85 
 
 		 1533 bp  143  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4745  ISPpu15, transposase Orf2  78.85 
 
 		 1533 bp  143  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.551625  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1718  IS66 Orf2 family protein  81.97 
 
 		 360 bp  129  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0521  IS66 Orf2 family protein  81.97 
 
 		 360 bp  129  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4793  IS66 Orf2 family protein  81.97 
 
 		 360 bp  129  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0035  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.701861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0039  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0196  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.904246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0670  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1020  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1098  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1189  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633516  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1227  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2437  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.713289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2460  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2840  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0352443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2971  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3213  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3216  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.727249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3613  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3651  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3996  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222693  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3999  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00912569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4251  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4389  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4567  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4693  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4737  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4764  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4994  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5212  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5215  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5304  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5368  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5411  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5443  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5445  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5543  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5591  ISPsy5, transposase  79.68 
 
 		 1554 bp  117  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3113  ISPpu13, transposase Orf1  81.12 
 
 		 360 bp  113  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.643108  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3986  ISPpu13, transposase Orf1  80.87 
 
 		 357 bp  107  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3221  ISPsy5, Orf1  78.61 
 
 		 360 bp  103  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0651987  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0338  hypothetical protein  100 
 
 		 276 bp  95.6  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33588  predicted protein  100 
 
 		 1299 bp  93.7  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.377381  normal  0.0708275 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0045  hypothetical protein  100 
 
 		 138 bp  93.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386457  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0534  hypothetical protein  100 
 
 		 318 bp  93.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.400881  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1221    86.41 
 
 		 1029 bp  93.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1445  DNA translocase FtsK  100 
 
 		 3324 bp  93.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64751  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1004  hypothetical protein  100 
 
 		 192 bp  93.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3389  hypothetical protein  100 
 
 		 411 bp  89.7  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  84.17 
 
 		 1593 bp  87.7  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5371  ISPsy5, Orf1  80.19 
 
 		 360 bp  87.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.018412  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  84.17 
 
 		 1593 bp  87.7  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  84.4 
 
 		 2085 bp  81.8  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2392  ISPsy5, Orf1  79.72 
 
 		 360 bp  79.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00116713  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3966  ISPsy5, Orf1  78.62 
 
 		 360 bp  79.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343547  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1017  hypothetical protein  94 
 
 		 150 bp  75.8  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119643  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0188  hypothetical protein  94 
 
 		 150 bp  75.8  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3445  hypothetical protein  100 
 
 		 189 bp  73.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4657    83.49 
 
 		 663 bp  73.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1016  hypothetical protein  83.5 
 
 		 1605 bp  69.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1225    83.5 
 
 		 1869 bp  69.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1404  RNA polymerase sigma factor HrpL  84.21 
 
 		 555 bp  69.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2462    83.5 
 
 		 633 bp  69.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14393  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_1223    78.9 
 
 		 360 bp  67.9  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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