More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0018 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  60.98 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  60.98 
 
 		 177 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  53.38 
 
 		 208 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  56.3 
 
 		 207 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  55.56 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  56.49 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  51.8 
 
 		 225 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  54.89 
 
 		 205 aa  158  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  52.76 
 
 		 226 aa  158  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  45.83 
 
 		 209 aa  145  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  45.24 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  46.26 
 
 		 230 aa  141  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  45.57 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  42.94 
 
 		 181 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  50 
 
 		 197 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  50.75 
 
 		 179 aa  138  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  47.2 
 
 		 283 aa  137  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  46.1 
 
 		 173 aa  137  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  44.22 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  43.92 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  47.54 
 
 		 283 aa  135  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  44.22 
 
 		 177 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  43.03 
 
 		 177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  49.17 
 
 		 273 aa  135  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  48.51 
 
 		 181 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  42 
 
 		 283 aa  134  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  42 
 
 		 283 aa  133  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  47.76 
 
 		 178 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  42 
 
 		 283 aa  133  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  44.53 
 
 		 271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  44.53 
 
 		 271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  44.53 
 
 		 275 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  44.53 
 
 		 271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  44.53 
 
 		 271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  44.53 
 
 		 271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  44.53 
 
 		 271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  44.53 
 
 		 271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  44.53 
 
 		 271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  50.38 
 
 		 133 aa  132  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  47.76 
 
 		 205 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  45.53 
 
 		 324 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  47.01 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  43.75 
 
 		 273 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  43.75 
 
 		 273 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  43.75 
 
 		 273 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  43.75 
 
 		 273 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  43.75 
 
 		 273 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  47.66 
 
 		 205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1684  NLP/P60 protein  45.08 
 
 		 356 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  40.56 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  43.44 
 
 		 221 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  44 
 
 		 224 aa  124  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  43.55 
 
 		 223 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  40.56 
 
 		 212 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  47.69 
 
 		 234 aa  124  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  42.96 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  45.04 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  45.19 
 
 		 203 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 214 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  42.25 
 
 		 183 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  42.4 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  42.4 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  42.4 
 
 		 234 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  44 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  43.2 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  44 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  43.2 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  42.4 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  44 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  42.4 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  42.4 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  42.4 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  42.4 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  43.38 
 
 		 226 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  43.2 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  42.62 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  49.18 
 
 		 221 aa  121  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  44.27 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  45.97 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  45.97 
 
 		 192 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  37.79 
 
 		 363 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  37.79 
 
 		 363 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  37.79 
 
 		 363 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  38.26 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  37.57 
 
 		 364 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 369 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 354 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0239  NlpC/P60 family protein  44.72 
 
 		 249 aa  115  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  44.26 
 
 		 201 aa  114  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  41.94 
 
 		 404 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  43.55 
 
 		 220 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0271  NlpC/P60 family protein  43.9 
 
 		 257 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.677165 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 353 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3380  NLP/P60 protein  44.72 
 
 		 234 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00222  predicted lipoprotein and C40 family peptidase  43.9 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  42.06 
 
 		 226 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>