290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2096 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
175 aa  344  4e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  81.71 
 
 
175 aa  290  5e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  78.29 
 
 
175 aa  276  1e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  73.14 
 
 
175 aa  265  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  73.14 
 
 
175 aa  264  5e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  78.29 
 
 
175 aa  263  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  69.71 
 
 
175 aa  256  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  46.47 
 
 
171 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  39.31 
 
 
175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  37.36 
 
 
179 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  37.93 
 
 
179 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  37.36 
 
 
179 aa  124  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  39.02 
 
 
165 aa  123  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  37.04 
 
 
164 aa  117  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  38.65 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  36.42 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  37.11 
 
 
164 aa  100  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  33.77 
 
 
194 aa  99.4  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  33.14 
 
 
178 aa  97.8  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  31.36 
 
 
171 aa  97.4  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  37.82 
 
 
166 aa  95.5  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  37.67 
 
 
164 aa  94  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  34.62 
 
 
162 aa  92.8  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  28.99 
 
 
173 aa  91.3  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  28.99 
 
 
173 aa  91.3  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  36.49 
 
 
151 aa  90.9  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  32.05 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  29.48 
 
 
238 aa  89  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  34.97 
 
 
163 aa  89  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  31.48 
 
 
168 aa  87.4  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  31.41 
 
 
168 aa  87  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  31.41 
 
 
168 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1517  ATP synthase F0, B subunit  36.25 
 
 
165 aa  87  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  31.18 
 
 
168 aa  86.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  31.52 
 
 
206 aa  85.5  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  31.41 
 
 
168 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  31.41 
 
 
168 aa  84.7  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  31.41 
 
 
168 aa  84.7  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  31.41 
 
 
168 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  30.77 
 
 
168 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  31.41 
 
 
168 aa  84.7  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  31.41 
 
 
168 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 
172 aa  84.7  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  33.97 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  31.48 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  32 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  35.33 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  33.56 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  35.33 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  34.53 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  30.49 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  31.21 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  31.58 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  30.72 
 
 
167 aa  80.5  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  28.67 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  32.91 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  33.76 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  34.67 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  32.41 
 
 
156 aa  79  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  29.14 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  34.67 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  34.67 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  34.67 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  34.67 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  34.67 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  34.67 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  32.12 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  35.71 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  35.1 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  32.47 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  28.86 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  32.65 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  32.7 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  32.65 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  28.22 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  29.27 
 
 
203 aa  74.3  0.0000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  32.41 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  29.22 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4190  F0F1 ATP synthase subunit B  37.01 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000644927  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  28.48 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  31.25 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2801  F-type H+-transporting ATP synthase, subunit B  34.25 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0112017  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  28.48 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  31.71 
 
 
194 aa  72  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  30.86 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  29.56 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4611  ATP synthase F0, B subunit  30 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>