155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1806 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  745    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  47.14 
 
 		 383 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2248  hypothetical protein  47.19 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0302018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  28.26 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  28.02 
 
 		 367 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 367 aa  99.8  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  31.14 
 
 		 357 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  27.75 
 
 		 367 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  28.32 
 
 		 342 aa  92.8  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  24.16 
 
 		 386 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  30.68 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  31.23 
 
 		 350 aa  87  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  28.92 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  29.75 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  30.32 
 
 		 366 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  28.88 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0095  protein of unknown function DUF955  27.56 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  29.31 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  28.63 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  24.71 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  24.71 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  23.51 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  31.4 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4169  helix-turn-helix domain protein  26.83 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00295679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  27.3 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  31.1 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  27.64 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  28.7 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  25.98 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  25.95 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  26.81 
 
 		 360 aa  67  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  30.19 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  28.25 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  24.1 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  26.6 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  26.19 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  23.71 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  26.41 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1409  protein of unknown function DUF955  29.24 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02310  hypothetical protein  27.51 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4770  protein of unknown function DUF955  24.62 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.166779  hitchhiker  0.00150402 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  28.33 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4968  helix-turn-helix domain-containing protein  30.7 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0119707 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  29.61 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1425  hypothetical protein  25.57 
 
 		 416 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  26.67 
 
 		 382 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  26.42 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  32.61 
 
 		 182 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  26.76 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  24.25 
 
 		 347 aa  54.7  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  23.1 
 
 		 382 aa  53.9  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2625  transcriptional regulator, XRE family  35.8 
 
 		 217 aa  53.5  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4623  hypothetical protein  24.66 
 
 		 255 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  24.8 
 
 		 375 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  31.52 
 
 		 351 aa  53.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4601  hypothetical protein  24.66 
 
 		 255 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  25 
 
 		 372 aa  53.1  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  25.2 
 
 		 383 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  27.86 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  30.43 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  31.47 
 
 		 160 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  25.83 
 
 		 352 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  23.28 
 
 		 410 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  27.89 
 
 		 359 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  30.67 
 
 		 261 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 110 aa  49.7  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  23.84 
 
 		 393 aa  49.7  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9535  hypothetical transcription regulator protein  38.75 
 
 		 88 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111117  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0034  zinc-related peptidase  23.46 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000203877  decreased coverage  0.0000849316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 106 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  31.85 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  34.71 
 
 		 173 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  29.02 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 182 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  22.41 
 
 		 181 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 181 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  26.75 
 
 		 266 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 219 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 211 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  31.13 
 
 		 286 aa  47  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0843  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 71 aa  47  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 248 aa  46.6  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 69 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 69 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4245  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 397 aa  46.6  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  30.94 
 
 		 188 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 69 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2541  protein of unknown function DUF955  24.5 
 
 		 295 aa  46.6  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.24198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 197 aa  46.2  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  37.88 
 
 		 68 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1586  protein of unknown function DUF955  39.24 
 
 		 129 aa  46.2  0.0009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.764217  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 178 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  34.92 
 
 		 178 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  34.92 
 
 		 178 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  34.92 
 
 		 178 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  34.92 
 
 		 178 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 178 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  34.92 
 
 		 178 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>