120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1767 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  100 
 
 
196 aa  396  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  55.49 
 
 
185 aa  208  5e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  53.3 
 
 
187 aa  192  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  50 
 
 
182 aa  181  7e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  47.78 
 
 
196 aa  160  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1448  outer membrane protein OmpH  44.44 
 
 
181 aa  159  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  42.86 
 
 
184 aa  153  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  30.12 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.08 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  25.32 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1689  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.85 
 
 
341 aa  71.2  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.34 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  25.29 
 
 
213 aa  62  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.85 
 
 
211 aa  61.6  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.65 
 
 
188 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_002950  PG0193  cationic outer membrane protein OmpH  31.08 
 
 
163 aa  58.2  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.757024 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.24 
 
 
214 aa  57.8  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1053  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.83 
 
 
178 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.093719  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30 
 
 
221 aa  55.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  23.45 
 
 
174 aa  53.5  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.92 
 
 
165 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.58 
 
 
168 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.84 
 
 
176 aa  53.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.73 
 
 
169 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  30.13 
 
 
176 aa  52.8  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.14 
 
 
172 aa  52.8  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.3 
 
 
173 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.54 
 
 
168 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  24.07 
 
 
172 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  26.06 
 
 
171 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0060  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.58 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2876  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195839  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.83 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2418  outer membrane protein  24.86 
 
 
171 aa  49.3  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.06 
 
 
175 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  26.17 
 
 
190 aa  48.5  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0666  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.21 
 
 
175 aa  48.1  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156148  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  27.59 
 
 
167 aa  47.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.06 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2626  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.86 
 
 
164 aa  47.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.905788 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3152  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.14 
 
 
164 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000722219  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.06 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.06 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.15 
 
 
171 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 
171 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2446  outer membrane protein OmpH, putative  26.49 
 
 
168 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0885473  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1546  OmpH/HlpA family outer membrane protein  28.47 
 
 
177 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4107  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2573  OmpH/HlpA family outer membrane protein  28.47 
 
 
167 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28 
 
 
171 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2036  OmpH/HlpA family outer membrane protein  28.47 
 
 
177 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0642632  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.47 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.47 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2046  OmpH/HlpA family outer membrane protein  28.47 
 
 
177 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.281485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3265  OmpH/HlpA family outer membrane protein  28.47 
 
 
177 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2427  outer membrane protein  28.47 
 
 
168 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2483  outer membrane protein  28.47 
 
 
168 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453843  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1318  OmpH/HlpA family outer membrane protein  28.47 
 
 
168 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4435  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.35 
 
 
190 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.48 
 
 
178 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  24.48 
 
 
178 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.15 
 
 
171 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1562  OmpH family outer membrane protein  28.48 
 
 
172 aa  46.2  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0536  periplasmic chaperone  24.7 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.201411  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.14 
 
 
175 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1357  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.16 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591306  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1022  periplasmic chaperone  28.66 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0216507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3426  periplasmic chaperone  28.66 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000698403  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1075  periplasmic chaperone  28.66 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.21 
 
 
167 aa  45.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24 
 
 
175 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00455548  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 
172 aa  45.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00176  periplasmic chaperone  28.57 
 
 
161 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000232591  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3425  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.57 
 
 
161 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000142566  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.78 
 
 
165 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3414  ompH family outer membrane protein  28.85 
 
 
216 aa  45.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.556312  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0624  outer membrane protein  26.7 
 
 
165 aa  45.4  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000291301  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0180  periplasmic chaperone  28.57 
 
 
161 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.80617e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0182  periplasmic chaperone  28.57 
 
 
161 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000231614  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0725  putative outer membrane chaperone protein Skp  26.7 
 
 
165 aa  45.4  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3482  periplasmic chaperone  28.57 
 
 
161 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000160675  normal  0.0663519 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0189  periplasmic chaperone  28.57 
 
 
161 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000067294  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0171  periplasmic chaperone  28.57 
 
 
161 aa  45.4  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000364139  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0188  periplasmic chaperone  28.57 
 
 
161 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000198336  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00175  hypothetical protein  28.57 
 
 
161 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000443159  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2632  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 
165 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2699  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 
165 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000309047  hitchhiker  0.00333472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2806  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 
165 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000137224  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3272  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.03 
 
 
166 aa  45.1  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000377724  hitchhiker  0.00131424 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1459  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.4 
 
 
165 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1454  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.4 
 
 
165 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1490  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.4 
 
 
165 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000751414  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.4 
 
 
168 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3156  periplasmic chaperone  27.56 
 
 
165 aa  44.7  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010992  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1638  outer membrane protein OmpH  26.67 
 
 
168 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.73 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1854  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.38 
 
 
176 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1279  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.5 
 
 
165 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000429908  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0818  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.3 
 
 
139 aa  44.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.78632  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0988  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1842  outer membrane protein OmpH  29.78 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00348927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>