More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1763 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0421  protein of unknown function DUF214  73.93 
 
 
422 aa  636  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1763  putative ABC transporter, integral membrane protein  100 
 
 
422 aa  835  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.412712 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0386  hypothetical protein  74.41 
 
 
422 aa  647  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.574376  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0317  protein of unknown function DUF214  73.22 
 
 
422 aa  630  1e-179  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  68.72 
 
 
422 aa  599  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0418  protein of unknown function DUF214  67.54 
 
 
422 aa  580  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0611297 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0385  protein of unknown function DUF214  68.48 
 
 
422 aa  559  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0295868  normal  0.0668384 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0609  protein of unknown function DUF214  33.73 
 
 
422 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  9.28533e-06  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0551  protein of unknown function DUF214  33.57 
 
 
422 aa  211  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  6.38831e-05  normal  0.237108 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1781  lipoprotein releasing system  30.46 
 
 
424 aa  208  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0490622  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0718  protein of unknown function DUF214  31.49 
 
 
424 aa  204  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0590  hypothetical protein  30.99 
 
 
424 aa  192  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1599  lipoprotein releasing system  32.06 
 
 
422 aa  188  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.526116 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2534  hypothetical protein  30.16 
 
 
416 aa  175  1e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176241  normal  0.761271 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  29.86 
 
 
416 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0832  protein of unknown function DUF214  29.69 
 
 
417 aa  166  1e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  28.1 
 
 
411 aa  165  1e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1839  protein of unknown function DUF214  26.89 
 
 
416 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  0.633197 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0912  hypothetical protein  28.84 
 
 
416 aa  154  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0881  hypothetical protein  28.61 
 
 
416 aa  153  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.54 
 
 
420 aa  152  9e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.41 
 
 
424 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  26.12 
 
 
419 aa  145  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2749  hypothetical protein  28.7 
 
 
409 aa  145  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0349567  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.77 
 
 
416 aa  139  9e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.67 
 
 
416 aa  135  2e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.17 
 
 
420 aa  134  4e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.61 
 
 
423 aa  131  2e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.07 
 
 
414 aa  130  5e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  26.27 
 
 
423 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  24.41 
 
 
389 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  2.35465e-07  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0081  hypothetical protein  28.09 
 
 
420 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.466459  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2111  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  24.32 
 
 
427 aa  120  5e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  22.87 
 
 
389 aa  120  5e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.52 
 
 
408 aa  120  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.15 
 
 
411 aa  119  1e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3743  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.58 
 
 
410 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14534  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.73 
 
 
421 aa  117  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1906  hypothetical protein  24.49 
 
 
414 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000396781  hitchhiker  0.00508578 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.78 
 
 
417 aa  117  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.49 
 
 
415 aa  114  4e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1609  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.49 
 
 
414 aa  114  4e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0146346  normal  0.0646675 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3477  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  25.67 
 
 
422 aa  112  1e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  23.4 
 
 
414 aa  112  1e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3411  ABC transporter, inner membrane subunit  27.18 
 
 
405 aa  112  2e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2993  protein of unknown function DUF214  26.86 
 
 
375 aa  111  2e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1199  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.69 
 
 
416 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.132324 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.07 
 
 
414 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1747  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.32 
 
 
414 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  23.57 
 
 
389 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  26.07 
 
 
414 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1563  protein of unknown function DUF214  25.87 
 
 
385 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1986  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.29 
 
 
418 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.914701  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3827  hypothetical protein  24.15 
 
 
408 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0384  lipoprotein releasing system transmembrane protein  23.32 
 
 
413 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1761  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.56 
 
 
414 aa  107  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1541  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.38 
 
 
413 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.470748  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1607  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.84 
 
 
415 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.345047  normal  0.129769 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0348  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.09 
 
 
413 aa  106  7e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.49 
 
 
414 aa  106  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299394  normal  0.273871 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00597  lipoprotein releasing system transmembrane protein  23.6 
 
 
416 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.429172  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  22.77 
 
 
414 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2669  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.44 
 
 
415 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1673  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.97 
 
 
413 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3560  protein of unknown function DUF214  26.21 
 
 
405 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3974  protein of unknown function DUF214  28.09 
 
 
952 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146468  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2201  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  25.85 
 
 
413 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25450  hypothetical protein  22.84 
 
 
433 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1840  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 
408 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2156  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.97 
 
 
413 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3586  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.97 
 
 
413 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.14 
 
 
411 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  2.87642e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1577  protein of unknown function DUF214  22.69 
 
 
401 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.340093  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  22.14 
 
 
408 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1697  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.74 
 
 
413 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2175  hypothetical protein  23.06 
 
 
414 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1470  hypothetical protein  23.82 
 
 
404 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14710  Lipoprotein releasing system, hypothetical protein  24.26 
 
 
414 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.016176  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1040  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.78 
 
 
416 aa  100  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.678846 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1920  protein of unknown function DUF214  26.54 
 
 
470 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.911684  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3882  hypothetical protein  23.06 
 
 
408 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00664536  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.27 
 
 
408 aa  99.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3383  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.89 
 
 
409 aa  99.4  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.85 
 
 
414 aa  98.6  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3479  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  21.41 
 
 
422 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.640884  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1280  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.73 
 
 
434 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0107812  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3567  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.17 
 
 
423 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.756596  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6489  protein of unknown function DUF214  26.07 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2173  hypothetical protein  22.72 
 
 
416 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1076  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.79 
 
 
416 aa  97.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0609031  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2584  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.5 
 
 
417 aa  97.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297179  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2639  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.5 
 
 
417 aa  97.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1079  hypothetical protein  27.25 
 
 
655 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0832  protein of unknown function DUF214  23.52 
 
 
383 aa  97.1  5e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1811  addiction module toxin, Txe/YoeB  23.18 
 
 
412 aa  97.1  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.556262  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1887  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  24.5 
 
 
448 aa  96.7  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358126  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25430  hypothetical protein  22.72 
 
 
416 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2201  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  24.5 
 
 
417 aa  96.3  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3117  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  24.5 
 
 
417 aa  96.3  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139824  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1578  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24 
 
 
417 aa  96.3  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>