52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1752 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  390  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  43.44 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  44.35 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  45.05 
 
 		 222 aa  158  5e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  41.03 
 
 		 234 aa  141  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  40.34 
 
 		 237 aa  128  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  38.3 
 
 		 249 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  39.11 
 
 		 231 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  37.56 
 
 		 203 aa  112  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  37.28 
 
 		 227 aa  111  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  39.04 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  38.42 
 
 		 227 aa  106  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  38.81 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  37.88 
 
 		 215 aa  98.6  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  36.56 
 
 		 202 aa  96.3  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  38.1 
 
 		 212 aa  95.5  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  34.72 
 
 		 202 aa  94.7  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  33.49 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  39.72 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  42.75 
 
 		 190 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  35.54 
 
 		 195 aa  88.2  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  34.87 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  37.5 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  33.33 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  32.83 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  31.63 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  29.67 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  31.03 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  28.64 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  28.57 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  26.95 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  29.38 
 
 		 364 aa  54.7  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  26.84 
 
 		 359 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  35.34 
 
 		 229 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  27.68 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  35.46 
 
 		 361 aa  53.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  26.29 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1649  OmpA/MotB domain protein  32.78 
 
 		 380 aa  50.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  31.09 
 
 		 239 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  31.09 
 
 		 239 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  36.47 
 
 		 239 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  36.47 
 
 		 239 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  35.16 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  31.5 
 
 		 238 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  31.05 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  31.05 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  31.62 
 
 		 357 aa  45.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  28.44 
 
 		 245 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  27.56 
 
 		 401 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  28.87 
 
 		 373 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  27.27 
 
 		 373 aa  42.4  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  28.57 
 
 		 288 aa  42  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>