More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1703 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
145 aa  296  5e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  67.38 
 
 
142 aa  204  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  66.67 
 
 
142 aa  204  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  67.61 
 
 
142 aa  203  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  67.88 
 
 
144 aa  199  9e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  70.9 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  55.56 
 
 
144 aa  140  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  55.73 
 
 
138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  53.19 
 
 
139 aa  137  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50 
 
 
139 aa  135  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.13 
 
 
138 aa  132  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  49.26 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.11 
 
 
140 aa  131  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.84 
 
 
143 aa  130  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  52.17 
 
 
150 aa  130  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.82 
 
 
152 aa  130  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.74 
 
 
137 aa  130  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  51.91 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  48.18 
 
 
150 aa  124  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  47.45 
 
 
151 aa  123  9e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.48 
 
 
141 aa  123  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  48.03 
 
 
143 aa  122  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  46.97 
 
 
145 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
140 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  50.38 
 
 
143 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  48.92 
 
 
164 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  48.46 
 
 
144 aa  121  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.79 
 
 
137 aa  121  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  51.91 
 
 
144 aa  120  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  48.84 
 
 
138 aa  120  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  48.84 
 
 
140 aa  120  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.06 
 
 
137 aa  120  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  48.46 
 
 
141 aa  119  9e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  44.2 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.22 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  45.65 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  45.83 
 
 
145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  45.65 
 
 
145 aa  118  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  47.45 
 
 
144 aa  118  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  50.38 
 
 
143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  50 
 
 
139 aa  114  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  48.85 
 
 
148 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  42.22 
 
 
133 aa  113  7.999999999999999e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1707  arsenate reductase  46.4 
 
 
134 aa  111  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0993958  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  45.9 
 
 
127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  48.89 
 
 
140 aa  110  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  46.62 
 
 
132 aa  110  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  46.56 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  46.56 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  47.37 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  45.45 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  50.94 
 
 
258 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.29 
 
 
144 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.03 
 
 
139 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.7 
 
 
157 aa  105  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  48.41 
 
 
143 aa  105  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0533  arsenate reductase, putative  39.58 
 
 
171 aa  104  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
284 aa  104  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  45.67 
 
 
258 aa  103  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  43.28 
 
 
299 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.11 
 
 
159 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  45.39 
 
 
142 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  44.29 
 
 
154 aa  100  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  43.31 
 
 
138 aa  100  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  41.67 
 
 
158 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  43.41 
 
 
154 aa  100  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  43.7 
 
 
164 aa  99.4  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  45.26 
 
 
173 aa  99.4  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  43.65 
 
 
254 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  42.74 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40 
 
 
146 aa  99.4  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1425  protein tyrosine phosphatase  41.3 
 
 
141 aa  99  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694751  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6329  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720558  normal  0.0816451 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  43.28 
 
 
131 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  41.35 
 
 
167 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.35 
 
 
167 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
164 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  45.19 
 
 
132 aa  97.8  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2768  protein tyrosine phosphatase  43.88 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.79 
 
 
299 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2602  arsenate reductase  39.49 
 
 
188 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000913813  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0820  protein tyrosine phosphatase  42.25 
 
 
150 aa  97.1  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.580395  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2184  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.86 
 
 
133 aa  97.1  8e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000653418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  44.03 
 
 
134 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0756  protein tyrosine phosphatase  43.06 
 
 
153 aa  96.7  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.686448  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  42.54 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.24 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  40.74 
 
 
164 aa  95.5  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  40.97 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3666  protein tyrosine phosphatase  41.35 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  37.06 
 
 
174 aa  95.9  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3119  protein tyrosine phosphatase  41.3 
 
 
168 aa  95.5  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3579  protein tyrosine phosphatase  40.74 
 
 
164 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.747703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.35 
 
 
172 aa  94.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  44.85 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5346  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.74 
 
 
164 aa  94.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.524005 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0314  arsenate reductase  40 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03334  arsenate reductase  47.52 
 
 
128 aa  94.7  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  42.54 
 
 
134 aa  94  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  43.28 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>