More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1695 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  100 
 
 
360 aa  718    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  62 
 
 
360 aa  447  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  64.57 
 
 
361 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  58.76 
 
 
363 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.65 
 
 
360 aa  378  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.24 
 
 
368 aa  369  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  50.14 
 
 
360 aa  365  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.09 
 
 
383 aa  133  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  27.32 
 
 
407 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  30.13 
 
 
380 aa  123  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  28.49 
 
 
338 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  28.12 
 
 
338 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  27.22 
 
 
367 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  26.9 
 
 
368 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  31.17 
 
 
343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66716  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.2 
 
 
397 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  28.22 
 
 
421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.95 
 
 
420 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  25.72 
 
 
348 aa  116  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  27.61 
 
 
424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  30.36 
 
 
380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.23 
 
 
476 aa  113  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  26.6 
 
 
421 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  27.47 
 
 
366 aa  112  9e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  29.22 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2977  RND family efflux transporter MFP subunit  27.12 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540318  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  28.37 
 
 
390 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  27.22 
 
 
364 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  24.87 
 
 
429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  26.72 
 
 
357 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  26.49 
 
 
368 aa  110  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  26.2 
 
 
368 aa  109  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0080  RND family efflux transporter MFP subunit  26.49 
 
 
414 aa  109  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95759  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  28.29 
 
 
388 aa  109  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  26.84 
 
 
400 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  27.37 
 
 
426 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.13 
 
 
376 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.04 
 
 
380 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.41 
 
 
388 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  25.86 
 
 
357 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3749  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 
340 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  26.09 
 
 
351 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0779  RND family efflux transporter MFP subunit  26.09 
 
 
415 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.521132  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  26.09 
 
 
351 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  26.38 
 
 
404 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  27.78 
 
 
405 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 
377 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  25.91 
 
 
354 aa  102  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  28.66 
 
 
405 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.11 
 
 
414 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  29.7 
 
 
406 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  29.7 
 
 
382 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.88 
 
 
405 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  26.63 
 
 
376 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  26.27 
 
 
404 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  27.16 
 
 
382 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.86 
 
 
453 aa  100  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  26.93 
 
 
370 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.76 
 
 
404 aa  99.8  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2481  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.13 
 
 
367 aa  99.8  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  27.37 
 
 
402 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  28.99 
 
 
376 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.71 
 
 
407 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3561  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.96 
 
 
420 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.306068  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  26.74 
 
 
449 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.36 
 
 
369 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1983  RND family efflux transporter MFP subunit  26.33 
 
 
416 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  25.7 
 
 
373 aa  98.2  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  27.81 
 
 
375 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  27.17 
 
 
402 aa  97.4  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  28.7 
 
 
417 aa  97.4  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  26.74 
 
 
340 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  24.28 
 
 
353 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13281  membrane fusion protein  23.89 
 
 
353 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.403546  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3303  RND family efflux transporter MFP subunit  27.13 
 
 
418 aa  97.4  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3496  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  27.65 
 
 
517 aa  97.4  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  26.27 
 
 
444 aa  97.4  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.76 
 
 
354 aa  96.7  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  26.3 
 
 
360 aa  96.7  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  26.03 
 
 
392 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  28.65 
 
 
383 aa  95.9  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.6 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  25.72 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.36 
 
 
416 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.55 
 
 
362 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  28.2 
 
 
382 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  26.01 
 
 
405 aa  95.9  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.01 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  27.82 
 
 
429 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  25.6 
 
 
393 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3412  secretion protein HlyD  26.67 
 
 
443 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.96 
 
 
413 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2149  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.26 
 
 
409 aa  95.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12131  membrane fusion protein  25.4 
 
 
356 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.502636 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  28.38 
 
 
358 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  25.95 
 
 
372 aa  94  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1235  secretion protein HlyD  23.3 
 
 
353 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.681968  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  23.46 
 
 
372 aa  94  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3323  secretion protein HlyD  23.23 
 
 
459 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.01 
 
 
663 aa  94  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>