24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1674 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1674  cytochrome c, putative  100 
 
 
167 aa  344  3e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0507  cytochrome c, putative  72.86 
 
 
149 aa  222  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.032773  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1983  cytochrome c, putative  69.72 
 
 
150 aa  213  7e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000836955  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0501  cytochrome c, putative  66.44 
 
 
150 aa  209  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412522  normal  0.493523 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0464  cytochrome c, putative  63.7 
 
 
151 aa  201  5e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.778169  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0512  cytochrome c, putative  74.38 
 
 
147 aa  198  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0224  hypothetical protein  59.86 
 
 
163 aa  187  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.994888  normal  0.521983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0607  hypothetical protein  65.12 
 
 
144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1317  hypothetical protein  50 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000161565  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0545  hypothetical protein  46.21 
 
 
155 aa  121  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0700  hypothetical protein  40 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  39.67 
 
 
438 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0358  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.148188  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0969  hypothetical protein  36.79 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.193752 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08526  hypothetical protein  37.14 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  39.45 
 
 
314 aa  68.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2389  hypothetical protein  33.6 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.243985  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3068  hypothetical protein  29.82 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0502421  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11733  hypothetical protein  30.34 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0396  hypothetical protein  29.13 
 
 
162 aa  60.5  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0181746  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1848  hypothetical protein  35.16 
 
 
151 aa  57.8  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  25.34 
 
 
326 aa  51.6  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  28.17 
 
 
464 aa  48.1  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  29.21 
 
 
473 aa  42  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>