More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1503 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  72.98 
 
 		 474 aa  717    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  69.23 
 
 		 472 aa  676    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  74.26 
 
 		 476 aa  726    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  100 
 
 		 478 aa  974    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  72.01 
 
 		 472 aa  711    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  73.15 
 
 		 473 aa  724    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  68.09 
 
 		 477 aa  663    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  59.7 
 
 		 483 aa  558  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  57.76 
 
 		 480 aa  552  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  57.54 
 
 		 471 aa  536  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  58.15 
 
 		 479 aa  535  1e-151  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  57.02 
 
 		 471 aa  534  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  56.65 
 
 		 470 aa  533  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  54.31 
 
 		 475 aa  519  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  35.55 
 
 		 433 aa  233  8.000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  33.08 
 
 		 439 aa  229  7e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  36.93 
 
 		 434 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  33.5 
 
 		 428 aa  212  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  32.51 
 
 		 444 aa  211  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  30.46 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  30.9 
 
 		 459 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  31.78 
 
 		 446 aa  206  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  33.41 
 
 		 426 aa  206  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  31.87 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  31.61 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  29.53 
 
 		 428 aa  201  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  32.54 
 
 		 429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  26.8 
 
 		 448 aa  194  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  32.69 
 
 		 430 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  29.24 
 
 		 445 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  28.85 
 
 		 486 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 462 aa  170  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  28.96 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  28.5 
 
 		 471 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  28.5 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  30.4 
 
 		 477 aa  167  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000104661  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0931  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.38 
 
 		 465 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.988397  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  30.53 
 
 		 502 aa  166  9e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  29.97 
 
 		 433 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 		 449 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  25.59 
 
 		 441 aa  163  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1516  Radical SAM domain protein  25.82 
 
 		 469 aa  159  8e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0112694  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  29.83 
 
 		 509 aa  159  9e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  28.86 
 
 		 498 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1466  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1023  Radical SAM domain protein  26.33 
 
 		 467 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1537  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.92 
 
 		 462 aa  155  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.537529  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1644  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 468 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  30.14 
 
 		 520 aa  155  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  30.33 
 
 		 500 aa  153  5.9999999999999996e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0940  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.26 
 
 		 461 aa  153  7e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.481544 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1318  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25 
 
 		 471 aa  153  7e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0919  radical SAM domain-containing protein  28.23 
 
 		 422 aa  149  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1617  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 469 aa  147  5e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2731  Radical SAM domain protein  26.77 
 
 		 465 aa  144  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  27.71 
 
 		 529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  28.31 
 
 		 490 aa  141  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0513  radical SAM domain-containing protein  32.42 
 
 		 445 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000241934  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  29.81 
 
 		 503 aa  140  7e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3555  Radical SAM domain protein  31.49 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  28.9 
 
 		 501 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0200  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 468 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0997671  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  29.02 
 
 		 527 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  28.85 
 
 		 504 aa  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0116  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.56 
 
 		 461 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0267  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  29.54 
 
 		 503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1975  Radical SAM domain protein  27.65 
 
 		 468 aa  134  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00675749  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 468 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  26.98 
 
 		 523 aa  134  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0407  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.6 
 
 		 466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  26.5 
 
 		 490 aa  133  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  28.82 
 
 		 600 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1806  Radical SAM domain protein  26.05 
 
 		 468 aa  133  7.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  28.73 
 
 		 503 aa  133  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  30.35 
 
 		 504 aa  133  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3556  Radical SAM domain protein  33.01 
 
 		 450 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1163  Radical SAM domain protein  30.51 
 
 		 444 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0548  radical SAM domain-containing protein  30.27 
 
 		 504 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 		 502 aa  127  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4335  radical SAM domain-containing protein  29.22 
 
 		 498 aa  127  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2757  Radical SAM domain protein  27.6 
 
 		 462 aa  126  9e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  29.57 
 
 		 532 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 		 533 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  25.39 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0738  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 525 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.170027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3535  Radical SAM domain protein  29.35 
 
 		 444 aa  121  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  24.21 
 
 		 522 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 		 512 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  27.13 
 
 		 542 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  25.56 
 
 		 533 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3160  Radical SAM domain protein  27.05 
 
 		 539 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  26.59 
 
 		 529 aa  113  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 529 aa  112  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 		 527 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0364  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 		 543 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1896  Radical SAM domain protein  29.52 
 
 		 554 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.22 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  26.54 
 
 		 529 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>