21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1442 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1442  hypothetical protein  100 
 
 
421 aa  859    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000040293  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2289  cytochrome c1 precursor protein  34.56 
 
 
450 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130595  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0914  putative cytochrome c1 signal peptide protein  41.67 
 
 
445 aa  58.9  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1778  cytochrome c  49.15 
 
 
446 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0545  putative cytochrome c1 signal peptide protein  35.04 
 
 
475 aa  57.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0196  putative cytochrome c1 signal peptide protein  37.07 
 
 
446 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0618  putative cytochrome c1 signal peptide protein  33.33 
 
 
455 aa  57.4  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84464  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1145  cytochrome c  29.93 
 
 
482 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1428  cytochrome c  29.93 
 
 
482 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0319  hypothetical protein  49.06 
 
 
493 aa  53.9  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000684718  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2751  cytochrome c  41.33 
 
 
485 aa  50.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0647826  hitchhiker  0.00000636935 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3153  cytochrome c  41.33 
 
 
485 aa  50.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3445  hypothetical protein  30.91 
 
 
385 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00254037  normal  0.641592 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00209  cytochrome C  33.85 
 
 
446 aa  50.1  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0434  hypothetical protein  39.19 
 
 
459 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  0.0528043 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3353  hypothetical protein  43.75 
 
 
443 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000199743  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1583  cytochrome c1 precursor protein  46.55 
 
 
468 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0727125  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2100  hypothetical protein  22.46 
 
 
449 aa  45.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0892  hypothetical protein  44.64 
 
 
443 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.81771e-31 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3615  hypothetical protein  50 
 
 
552 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0733  cytochrome c, putative  47.22 
 
 
231 aa  43.9  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00642674  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>