More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1406 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1406  shikimate kinase  100 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.812389  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1763  shikimate kinase  67.36 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0946  shikimate kinase  68.48 
 
 		 199 aa  249  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.133424  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0837  shikimate kinase  65.93 
 
 		 190 aa  244  8e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.8297  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0960  shikimate kinase  65.38 
 
 		 199 aa  239  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1516  shikimate kinase  63.74 
 
 		 197 aa  238  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.681098 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  63.19 
 
 		 190 aa  224  7e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2486  Shikimate kinase  46.11 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1591  Shikimate kinase  41.76 
 
 		 175 aa  121  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  38.6 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  36.63 
 
 		 166 aa  116  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  38.32 
 
 		 172 aa  115  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3659  Shikimate kinase  42.86 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  37.35 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  36.87 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  37.35 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  35.67 
 
 		 168 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  38.51 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  40.46 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  35.63 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1020  shikimate kinase  37.82 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  36.93 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  37.85 
 
 		 181 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1840  Shikimate kinase  36.72 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0636308  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2922  shikimate kinase  34.12 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  35.47 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12559  shikimate kinase  38.01 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121488  normal  0.108726 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  37.35 
 
 		 173 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  31.03 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3757  shikimate kinase  38.01 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28547 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  36.69 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  37.5 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3226  shikimate kinase  39.62 
 
 		 172 aa  102  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  34.09 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  35.63 
 
 		 172 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  35.14 
 
 		 180 aa  101  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01201  shikimate kinase  36.84 
 
 		 185 aa  101  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  33.16 
 
 		 193 aa  101  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  33.52 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  33.91 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0989  shikimate kinase  35.6 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.764928  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2209  shikimate kinase  38.75 
 
 		 165 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218962  normal  0.751084 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  32.35 
 
 		 165 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  32.35 
 
 		 165 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  32.35 
 
 		 165 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0220  Shikimate kinase  36.77 
 
 		 167 aa  99.8  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000013813  normal  0.0131612 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  34.62 
 
 		 181 aa  99  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2020  shikimate kinase  37.57 
 
 		 173 aa  99  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0278183 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0013  shikimate kinase  34.5 
 
 		 175 aa  99.4  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  35.84 
 
 		 179 aa  99  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  31.76 
 
 		 170 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  34.46 
 
 		 177 aa  98.2  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  35.06 
 
 		 172 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  31.76 
 
 		 165 aa  98.2  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6534  Shikimate kinase  36.84 
 
 		 167 aa  97.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.0132303 
 
 
-
 
NC_002950  PG1593  shikimate kinase  35.4 
 
 		 186 aa  97.8  9e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  31.76 
 
 		 165 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3524  Shikimate kinase  34.81 
 
 		 169 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.835023 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  32.76 
 
 		 171 aa  97.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2952  Shikimate kinase  39.16 
 
 		 171 aa  97.1  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000140842  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0658  shikimate kinase  33.33 
 
 		 178 aa  97.8  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2313  Shikimate kinase  37.13 
 
 		 168 aa  97.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0915782  hitchhiker  0.00353016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4020  shikimate kinase  31.4 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.263055  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1308  shikimate kinase  38.07 
 
 		 172 aa  97.4  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211808 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1091  shikimate kinase  41.14 
 
 		 172 aa  96.7  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.393566  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1476  shikimate kinase  32.24 
 
 		 198 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  36.77 
 
 		 172 aa  96.7  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2394  shikimate kinase  35.03 
 
 		 235 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0537211  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2353  shikimate kinase  35.03 
 
 		 235 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  31.18 
 
 		 165 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2400  shikimate kinase  35.03 
 
 		 235 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2646  shikimate kinase  35.67 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  33.53 
 
 		 176 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  33.53 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01791  shikimate kinase  33.54 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  36.26 
 
 		 579 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  31.18 
 
 		 165 aa  95.9  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  34.5 
 
 		 175 aa  95.9  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  34.5 
 
 		 175 aa  95.9  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  37.16 
 
 		 539 aa  95.5  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0253  3-dehydroquinate synthase  37.43 
 
 		 551 aa  95.1  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2745  Shikimate kinase  33.15 
 
 		 181 aa  95.1  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.11158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45250  shikimate kinase  37.14 
 
 		 172 aa  95.1  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3534  Shikimate kinase  36.14 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  31.18 
 
 		 165 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  32.16 
 
 		 176 aa  94.7  8e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0666  shikimate kinase I  34.5 
 
 		 171 aa  94.7  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1330  Shikimate kinase  32.98 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0593402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  32.78 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  38.56 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  29.82 
 
 		 170 aa  94.4  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1718  shikimate kinase  33.33 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.825758  normal  0.851225 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  32.18 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0722  shikimate kinase  34.64 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  39.24 
 
 		 577 aa  93.6  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  33.91 
 
 		 172 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  33.91 
 
 		 172 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  30.64 
 
 		 176 aa  93.2  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  33.92 
 
 		 168 aa  92.8  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3014  Shikimate kinase  36.48 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0650528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>