13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1373 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1373  hypothetical protein  100 
 
 
478 aa  966    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00411865  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1004  hypothetical protein  57.6 
 
 
470 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1816  hypothetical protein  53.73 
 
 
468 aa  531  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1847  hypothetical protein  51.87 
 
 
482 aa  527  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3878  hypothetical protein  39.43 
 
 
460 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3925  hypothetical protein  39.6 
 
 
461 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  0.418818 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0238  hypothetical protein  38.98 
 
 
466 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0374621 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2876  hypothetical protein  35.21 
 
 
461 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.477057  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2968  hypothetical protein  34.51 
 
 
461 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4257  hypothetical protein  28 
 
 
518 aa  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146201  normal  0.151056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0993  hypothetical protein  27.68 
 
 
502 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411338 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0835  hypothetical protein  28.48 
 
 
474 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2399  hypothetical protein  24.73 
 
 
488 aa  130  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>