51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1367 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1367  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  100 
 
 		 145 aa  298  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.646925 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1014  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  48.91 
 
 		 147 aa  130  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121242  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1826  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.14 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1839  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  43.61 
 
 		 140 aa  114  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.481374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4032  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2650  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1875  anti-sigma regulatory factor  30.37 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1584  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0933  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.74 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0815302  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2043  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.64 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000388253  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1685  anti-sigma B factor  28.23 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1929  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0887571  normal  0.148865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1426  rsbW protein, putative  26.4 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2469  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1228  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  25.6 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.011235 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2977  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase  27.93 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1516  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.124385  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2102  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.4 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0750  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.194451  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1794  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.5 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2102  serine-protein kinase RsbW  29.03 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178488  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2139  serine-protein kinase RsbW  29.03 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.69 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2468  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0214018  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1452  hypothetical protein  31.19 
 
 		 777 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  28.7 
 
 		 160 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1749  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2661  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0789133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  28.7 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1678  serine-protein kinase RsbW  29.25 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2079  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000225228 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  29.91 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  27.78 
 
 		 160 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  32.38 
 
 		 250 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 		 249 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 269 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2188  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.12 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0177  hypothetical protein  27.27 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.160815  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2331  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.21 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.122382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2838  putative anti-sigma regulatory factor serine/threonine protein kinase  29.11 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  26.85 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  28.97 
 
 		 160 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  28.97 
 
 		 160 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  26.85 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  26.85 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  28.97 
 
 		 160 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2936  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1162  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  26.09 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000640606  normal  0.134591 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.4 
 
 		 143 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>