More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1322 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1322  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
396 aa  818    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.403308  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0934  ATPase  78.99 
 
 
396 aa  637    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.894546  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1652  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  79.1 
 
 
397 aa  638    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.675136  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1622  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  82.84 
 
 
401 aa  648    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1014  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  77.48 
 
 
398 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.561354 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1470  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  72.39 
 
 
617 aa  596  1e-169  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0928579  normal  0.923251 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.06 
 
 
610 aa  362  6e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.34 
 
 
634 aa  340  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.39 
 
 
551 aa  334  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  43.75 
 
 
579 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0331  hypothetical protein  45.92 
 
 
629 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.517311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.58 
 
 
579 aa  323  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  45.65 
 
 
582 aa  323  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1233  DNA polymerase III, tau and gamma subunits  44.72 
 
 
381 aa  323  5e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710684  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.34 
 
 
582 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.12 
 
 
569 aa  318  7.999999999999999e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0736  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.49 
 
 
602 aa  317  3e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536606  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.69 
 
 
518 aa  315  9e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.32 
 
 
579 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.43 
 
 
559 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0023  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.3 
 
 
664 aa  308  8e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0608754  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.05 
 
 
582 aa  308  8e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4930  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.44 
 
 
621 aa  308  8e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522711  normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0542  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.73 
 
 
570 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000531282  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0052  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.73 
 
 
547 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0055  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.73 
 
 
547 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.66 
 
 
602 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3039  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.62 
 
 
678 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.34 
 
 
599 aa  302  6.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.39 
 
 
601 aa  302  9e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.39 
 
 
601 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.68 
 
 
589 aa  301  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.35 
 
 
561 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.4 
 
 
632 aa  300  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1510  DNA polymerase III, tau subunit / DNA polymerase III, gamma subunit  41.78 
 
 
648 aa  299  5e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0569414  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.19 
 
 
562 aa  299  7e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000227385  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.97 
 
 
562 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.24 
 
 
562 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  41.3 
 
 
548 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.23 
 
 
589 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.06 
 
 
547 aa  297  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3235  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.18 
 
 
690 aa  297  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00193084  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.39 
 
 
606 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1135  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.4 
 
 
650 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239786  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.97 
 
 
562 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.55 
 
 
562 aa  297  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.7 
 
 
562 aa  296  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.97 
 
 
562 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.97 
 
 
562 aa  296  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.94 
 
 
565 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.97 
 
 
562 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.94 
 
 
565 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.7 
 
 
562 aa  296  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.55 
 
 
562 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.47 
 
 
664 aa  296  5e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.97 
 
 
562 aa  296  6e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2852  DNA-directed DNA polymerase  41.51 
 
 
955 aa  296  6e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00013426  hitchhiker  0.000000946714 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1076  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.8 
 
 
685 aa  295  8e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258766  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25950  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  40.65 
 
 
796 aa  295  1e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.53 
 
 
522 aa  295  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.92 
 
 
447 aa  295  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.49 
 
 
606 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.18 
 
 
642 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0588  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.18 
 
 
642 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0544  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.18 
 
 
642 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1073  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.73 
 
 
553 aa  293  4e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.18 
 
 
642 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.18 
 
 
642 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.977578  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.16 
 
 
588 aa  292  6e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00421  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.91 
 
 
643 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00199359  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3140  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.91 
 
 
643 aa  290  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000034955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0561  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.91 
 
 
643 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00426  hypothetical protein  40.91 
 
 
643 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00196297  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.47 
 
 
649 aa  290  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0513  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.91 
 
 
643 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0325277  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0857  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.82 
 
 
681 aa  290  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0402  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.91 
 
 
643 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0412407  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0547  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.91 
 
 
643 aa  290  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.014697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0507  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.91 
 
 
643 aa  290  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000331221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.91 
 
 
643 aa  290  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000202258  normal  0.0671233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.35 
 
 
554 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1418  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  42.13 
 
 
602 aa  289  6e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.733892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19830  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.89 
 
 
694 aa  289  7e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0950  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.79 
 
 
642 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.194828  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44630  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.42 
 
 
701 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522569  normal  0.208913 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3198  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.74 
 
 
658 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.344651  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.35 
 
 
527 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3801  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.42 
 
 
681 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3587  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.74 
 
 
689 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.7 
 
 
939 aa  288  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000837393  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40 
 
 
637 aa  287  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.780836  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2889  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.74 
 
 
658 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.381742  normal  0.068134 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3059  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.74 
 
 
658 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1855  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.97 
 
 
587 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225715  normal  0.416564 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3834  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.74 
 
 
687 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.471872 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2647  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.4 
 
 
692 aa  286  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.377545  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0529  DNA-directed DNA polymerase  40.11 
 
 
696 aa  286  4e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000324921  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.84 
 
 
540 aa  286  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1851  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.09 
 
 
793 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.51542  normal  0.226661 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1738  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.6 
 
 
813 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206235  normal  0.0482422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>