More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1226 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  75.06 
 
 
393 aa  636    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  803    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  74.49 
 
 
393 aa  623  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  71.68 
 
 
393 aa  596  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  68.19 
 
 
393 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  64.8 
 
 
394 aa  552  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  65.05 
 
 
394 aa  541  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  42.42 
 
 
395 aa  310  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  43.81 
 
 
396 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  43.19 
 
 
392 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  40.1 
 
 
390 aa  298  1e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  39.85 
 
 
392 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  40.05 
 
 
415 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  41.48 
 
 
418 aa  292  6e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  42.42 
 
 
390 aa  292  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  40.36 
 
 
394 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  40 
 
 
394 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  43.41 
 
 
400 aa  289  7e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  42.38 
 
 
391 aa  288  9e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  42.01 
 
 
397 aa  286  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  39.49 
 
 
389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  39.85 
 
 
391 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  39.85 
 
 
391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3750  hypothetical protein  40.1 
 
 
398 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0864598 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  40.86 
 
 
407 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  38.94 
 
 
398 aa  281  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  40.61 
 
 
407 aa  280  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  41.8 
 
 
391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  37.53 
 
 
400 aa  273  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  42.35 
 
 
389 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  39.48 
 
 
391 aa  270  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  39.74 
 
 
398 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  37.95 
 
 
394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  39.74 
 
 
398 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  39.49 
 
 
398 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  39.23 
 
 
398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  38.48 
 
 
398 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  38.64 
 
 
413 aa  265  8e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  38.21 
 
 
397 aa  265  8e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  38.15 
 
 
409 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0614  SAM-dependent methyltransferase  36.87 
 
 
396 aa  265  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  38.44 
 
 
391 aa  265  1e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1889  hypothetical protein  37.08 
 
 
388 aa  265  2e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  38.46 
 
 
398 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0366  SAM-dependent methyltransferase  39.55 
 
 
403 aa  264  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0859295  normal  0.454449 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  38.97 
 
 
398 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1714  protein of unknown function Met10  40.35 
 
 
404 aa  263  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  39.75 
 
 
399 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  40.85 
 
 
426 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  37.47 
 
 
394 aa  263  4.999999999999999e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  38.72 
 
 
398 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  38.87 
 
 
399 aa  261  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  37.95 
 
 
398 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3451  SAM-dependent methyltransferase  37.94 
 
 
396 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  38.68 
 
 
397 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0812  hypothetical protein  38.27 
 
 
398 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.199944  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2446  hypothetical protein  39.95 
 
 
398 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.920431 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  38.82 
 
 
416 aa  257  2e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  37.33 
 
 
396 aa  253  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  37.33 
 
 
396 aa  253  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  37.33 
 
 
396 aa  253  5.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  37.92 
 
 
396 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  36.8 
 
 
396 aa  252  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  37.33 
 
 
396 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  37.33 
 
 
396 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  37.33 
 
 
391 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2702  putative SAM-dependent methyltransferase  37.28 
 
 
408 aa  251  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  36.8 
 
 
396 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0954  SAM-dependent methyltransferase  38.7 
 
 
384 aa  250  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  37.31 
 
 
396 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  36.77 
 
 
396 aa  249  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  37.56 
 
 
396 aa  249  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  37.31 
 
 
396 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  37.73 
 
 
396 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  35.81 
 
 
397 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  38.08 
 
 
396 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  37.11 
 
 
394 aa  247  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  38.08 
 
 
396 aa  246  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  36.64 
 
 
397 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  37.82 
 
 
396 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  37.82 
 
 
396 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  37.82 
 
 
396 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  37.15 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  37.05 
 
 
396 aa  244  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  34.78 
 
 
397 aa  243  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  36.87 
 
 
400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  35.47 
 
 
396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  35.47 
 
 
396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  35.47 
 
 
396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  37.09 
 
 
408 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  36.64 
 
 
397 aa  242  7e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  37.82 
 
 
367 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  37.82 
 
 
367 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  37.18 
 
 
397 aa  242  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  37.69 
 
 
400 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  37.69 
 
 
400 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  37.69 
 
 
400 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  36.17 
 
 
403 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  34.78 
 
 
418 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  37.34 
 
 
394 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>