18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1104 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1104  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  554  1e-157  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.176891  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1074  hypothetical protein  56.99 
 
 
269 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1260  hypothetical protein  50.89 
 
 
284 aa  280  2e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1497  hypothetical protein  47.35 
 
 
282 aa  254  7e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.307026  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1096  hypothetical protein  37.69 
 
 
283 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000563726  normal  0.588857 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0477  hypothetical protein  36.5 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3163  hypothetical protein  33.33 
 
 
323 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0343  putative pilus assembly protein chaperone PapD  28.35 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2550  hypothetical protein  25 
 
 
263 aa  58.9  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401431  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0517  hypothetical protein  28.79 
 
 
199 aa  57  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3592  hypothetical protein  28.72 
 
 
275 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1975  hypothetical protein  26.26 
 
 
268 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0990  hypothetical protein  22.82 
 
 
303 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4689  putataive fimbrial chaperone protein  26.53 
 
 
238 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0305  chaperone protein pmfD, putative  30.08 
 
 
243 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0779  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  21.69 
 
 
250 aa  46.6  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.765293  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0452  hypothetical protein  23.96 
 
 
268 aa  45.8  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000310711  decreased coverage  0.00000000190232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2625  hypothetical protein  22.54 
 
 
319 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>