More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1086 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.61 
 
 
231 aa  280  1e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  59.65 
 
 
231 aa  272  3e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.77 
 
 
238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.57 
 
 
234 aa  265  4e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.01 
 
 
236 aa  260  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.75 
 
 
235 aa  255  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
232 aa  218  7.999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.44 
 
 
232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  49.12 
 
 
231 aa  210  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  46.49 
 
 
232 aa  204  9e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  47.81 
 
 
232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.09 
 
 
233 aa  194  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  42.98 
 
 
233 aa  186  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 
219 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  32.49 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.27 
 
 
218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 
227 aa  109  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  34.6 
 
 
257 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  34.6 
 
 
257 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  37.04 
 
 
216 aa  105  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  32.38 
 
 
209 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  29.68 
 
 
221 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.38 
 
 
209 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  34.09 
 
 
219 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 
219 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  31.86 
 
 
219 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  32.3 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  32.34 
 
 
366 aa  93.6  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  33.96 
 
 
267 aa  90.5  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 
231 aa  89.7  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  32.44 
 
 
227 aa  89.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  30.53 
 
 
219 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  31.25 
 
 
219 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 
272 aa  85.9  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0100166 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 
212 aa  85.9  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7335  predicted protein  41.27 
 
 
126 aa  84.7  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.772508  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  33.2 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  31.38 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  30.13 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  27.93 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0956  hypothetical protein  32.54 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.652455  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  28.38 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  31.58 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  29.54 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  29.26 
 
 
321 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49437  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases-like protein  32.19 
 
 
308 aa  72  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  32.44 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42835  predicted protein  31.95 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  28.32 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  33.12 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  30.33 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.37 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  27.75 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 
301 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  28.32 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24256  predicted protein  27.87 
 
 
334 aa  63.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148146  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  28 
 
 
210 aa  63.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.12 
 
 
218 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  36.52 
 
 
500 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.8 
 
 
494 aa  63.5  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.49 
 
 
320 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.45 
 
 
320 aa  62.8  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  27.59 
 
 
276 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.75 
 
 
320 aa  62.4  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  27.85 
 
 
332 aa  62  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 
211 aa  62  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.61 
 
 
334 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 
358 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  36.3 
 
 
500 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  40.17 
 
 
493 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 
218 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42483  predicted protein  27.47 
 
 
386 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0692155  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.71 
 
 
494 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 
227 aa  59.7  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  28.25 
 
 
223 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  27.98 
 
 
327 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  24.43 
 
 
218 aa  59.7  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  27.75 
 
 
323 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  27.75 
 
 
323 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
215 aa  59.3  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  29.38 
 
 
291 aa  58.5  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.65 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.42 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  25.33 
 
 
288 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.22 
 
 
320 aa  57  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
300 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0581323  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  29.47 
 
 
297 aa  56.6  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1518  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 
333 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280588  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  29.56 
 
 
294 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 
297 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.199169 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 
320 aa  55.5  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  26.15 
 
 
325 aa  55.5  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  29.83 
 
 
294 aa  54.7  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>