More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1080 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1080  ATPase  100 
 
 
275 aa  558  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  66.26 
 
 
247 aa  348  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  71.91 
 
 
255 aa  347  1e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  66.39 
 
 
248 aa  340  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  65.55 
 
 
270 aa  337  9e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  55.7 
 
 
510 aa  276  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  54.4 
 
 
512 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  54.04 
 
 
257 aa  263  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  53.51 
 
 
319 aa  259  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  55.75 
 
 
314 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  54.02 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  54.75 
 
 
316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  53.19 
 
 
319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  52.12 
 
 
320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  52.4 
 
 
312 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  55.09 
 
 
319 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  55.36 
 
 
333 aa  250  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  53.42 
 
 
314 aa  249  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  51.06 
 
 
324 aa  248  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  53.12 
 
 
322 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 
309 aa  246  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  49.59 
 
 
582 aa  245  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  49.59 
 
 
581 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  49.58 
 
 
578 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  49.17 
 
 
578 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  49.59 
 
 
585 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  49.58 
 
 
578 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  49.58 
 
 
578 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  49.17 
 
 
578 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  49.17 
 
 
578 aa  243  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  49.17 
 
 
578 aa  243  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  49.58 
 
 
578 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  51.26 
 
 
579 aa  243  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  49.17 
 
 
578 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  49.17 
 
 
578 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  49.17 
 
 
578 aa  243  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  52.68 
 
 
350 aa  243  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  49.17 
 
 
578 aa  243  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  49.17 
 
 
578 aa  243  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  53.54 
 
 
322 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  49.58 
 
 
578 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  48.21 
 
 
580 aa  242  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  47.95 
 
 
576 aa  243  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 
580 aa  242  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  48.82 
 
 
580 aa  242  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  53.85 
 
 
322 aa  240  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  48.75 
 
 
579 aa  241  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  48.03 
 
 
585 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  53.85 
 
 
322 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  47.11 
 
 
582 aa  237  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  49.78 
 
 
325 aa  237  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  48.55 
 
 
576 aa  236  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  46.28 
 
 
583 aa  236  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 
541 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  47.48 
 
 
575 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  48.07 
 
 
311 aa  231  7.000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  50.92 
 
 
578 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  46.89 
 
 
580 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  47.9 
 
 
594 aa  229  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  46.89 
 
 
580 aa  229  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  46.47 
 
 
651 aa  229  3e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  45.02 
 
 
255 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  49.01 
 
 
599 aa  229  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  45.31 
 
 
590 aa  228  8e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  46.86 
 
 
580 aa  228  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  42.8 
 
 
335 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.81 
 
 
308 aa  227  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  45.61 
 
 
308 aa  226  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  49.6 
 
 
578 aa  226  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  46.67 
 
 
912 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  47.97 
 
 
593 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  48.17 
 
 
323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  47.84 
 
 
912 aa  225  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  47.46 
 
 
912 aa  225  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  46.38 
 
 
589 aa  225  6e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  44.84 
 
 
590 aa  225  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  46.49 
 
 
308 aa  224  8e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  44.27 
 
 
906 aa  224  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  44.77 
 
 
906 aa  224  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.41 
 
 
907 aa  224  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  48.17 
 
 
667 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  45.7 
 
 
1171 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  48.07 
 
 
911 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  44.58 
 
 
921 aa  222  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  45.11 
 
 
583 aa  222  6e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  44.35 
 
 
906 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  44.35 
 
 
906 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  46.55 
 
 
912 aa  221  9e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  45.11 
 
 
1017 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  45.83 
 
 
917 aa  219  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  46.84 
 
 
551 aa  219  5e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  46.03 
 
 
599 aa  218  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  43.82 
 
 
1066 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  46.98 
 
 
930 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  43.31 
 
 
1071 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  43.31 
 
 
1071 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  44.49 
 
 
1082 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  43.31 
 
 
1079 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  46.98 
 
 
916 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  43.31 
 
 
1089 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>