More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1019 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1019  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  502  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0426259 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  60.58 
 
 		 242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  46.09 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  40.62 
 
 		 148 aa  95.5  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  40.83 
 
 		 168 aa  93.2  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  40.83 
 
 		 168 aa  93.2  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  38.89 
 
 		 168 aa  92  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  39.39 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  27.78 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  34.62 
 
 		 819 aa  87  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  27.78 
 
 		 203 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  37.69 
 
 		 139 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  37.69 
 
 		 139 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  37.69 
 
 		 139 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  37.69 
 
 		 139 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  37.69 
 
 		 139 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  38.71 
 
 		 153 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  37.69 
 
 		 139 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  37.69 
 
 		 139 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  37.69 
 
 		 139 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  38.1 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  36.92 
 
 		 139 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.71 
 
 		 132 aa  83.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  32.56 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  35.43 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  35.43 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  35.43 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  38.1 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  31.25 
 
 		 149 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  33.85 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  36.51 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  35.94 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.57 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  34.62 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  31.78 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  35.77 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.88 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  36.29 
 
 		 138 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  36.29 
 
 		 138 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  34.65 
 
 		 139 aa  77.8  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  35.2 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0001  protein SamA  32.58 
 
 		 141 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2117  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.34 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  hitchhiker  0.000000326173 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.25 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  35.2 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  29.37 
 
 		 142 aa  77.4  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  35.2 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.4 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  37.4 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  36.36 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  35.2 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.4 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2558  LexA repressor  41.88 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.031889  normal  0.0134465 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  32.81 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2883  LexA repressor  37.98 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  37.3 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  30.66 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0145  LexA repressor  36.43 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0813581  normal  0.028375 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2792  LexA repressor  38.28 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147289  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2520  LexA repressor  39.06 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0774546  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1939  LexA repressor  40.8 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269028  normal  0.116637 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3216  LexA repressor  37.59 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  32.03 
 
 		 138 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  35.81 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3116  LexA repressor  46.59 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2601  LexA repressor  46.59 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.4 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1475  LexA repressor  37.23 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.457406 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0514  LexA repressor  38.97 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  28.36 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  31.25 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02088  LexA repressor  36.15 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  38.28 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.67 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  36.29 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3328  transcriptional repressor, LexA family  39.2 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3398  LexA repressor  38.98 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  33.07 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  23.17 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1549  LexA repressor  40.68 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.81 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2310  LexA repressor  40.68 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.389414  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0733  LexA repressor  38.24 
 
 		 202 aa  72  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03915  LexA repressor  40.68 
 
 		 202 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.499421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3950  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.68 
 
 		 202 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4283  LexA repressor  40.68 
 
 		 202 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03875  hypothetical protein  40.68 
 
 		 202 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.453972  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 204 aa  72  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4596  LexA repressor  40.68 
 
 		 202 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4505  LexA repressor  40.68 
 
 		 202 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4554  LexA repressor  40.68 
 
 		 202 aa  72  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5524  LexA repressor  40.68 
 
 		 202 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3985  LexA repressor  40.68 
 
 		 202 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.359891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4631  LexA repressor  40.68 
 
 		 202 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.381765 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4580  LexA repressor  40.68 
 
 		 202 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.285079 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4494  LexA repressor  40.68 
 
 		 202 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4429  LexA repressor  40.68 
 
 		 202 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  36.13 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4579  LexA repressor  40.68 
 
 		 202 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2741  LexA repressor  45.45 
 
 		 205 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>